More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1174 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  100 
 
 
587 aa  1178    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  54.29 
 
 
586 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  47.47 
 
 
574 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  44.88 
 
 
571 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  28.26 
 
 
599 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  29.96 
 
 
594 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  31.34 
 
 
616 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  30.1 
 
 
603 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  30.09 
 
 
587 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  32.32 
 
 
618 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.32 
 
 
595 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.5 
 
 
600 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  27.78 
 
 
676 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  27.44 
 
 
612 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  30.66 
 
 
597 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  27.56 
 
 
613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  27.49 
 
 
607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.67 
 
 
564 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  28.6 
 
 
606 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  27.4 
 
 
609 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  30.13 
 
 
600 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  27.13 
 
 
613 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  27.85 
 
 
749 aa  193  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.77 
 
 
577 aa  193  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  30.05 
 
 
597 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.21 
 
 
564 aa  190  8e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  26.99 
 
 
566 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  29.13 
 
 
746 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  26.82 
 
 
632 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  32.69 
 
 
580 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  29.54 
 
 
597 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.84 
 
 
582 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25 
 
 
564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  32.45 
 
 
580 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  26.29 
 
 
634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.24 
 
 
603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  28.95 
 
 
609 aa  184  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.82 
 
 
564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.06 
 
 
582 aa  183  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  24.83 
 
 
608 aa  183  8.000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.48 
 
 
582 aa  183  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  26.98 
 
 
616 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  27.83 
 
 
649 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  26.96 
 
 
577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  26.96 
 
 
577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  40.14 
 
 
596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.56 
 
 
611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  28.25 
 
 
575 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  27.08 
 
 
602 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.91 
 
 
579 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  32.98 
 
 
626 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  29.79 
 
 
613 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  28.8 
 
 
639 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 
597 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  28.49 
 
 
627 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  43.38 
 
 
739 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  29.08 
 
 
634 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  44.29 
 
 
741 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.14 
 
 
582 aa  179  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  30.15 
 
 
611 aa  178  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  27.41 
 
 
610 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  33.98 
 
 
595 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  29.84 
 
 
980 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  30.05 
 
 
578 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  30.43 
 
 
601 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  30.77 
 
 
720 aa  177  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  30.83 
 
 
578 aa  177  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  28.83 
 
 
930 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.11 
 
 
583 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.48 
 
 
581 aa  176  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3240  ABC transporter related  29.96 
 
 
567 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.4 
 
 
581 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.09 
 
 
585 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3103  ABC transporter related  41.94 
 
 
696 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519586  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  28.03 
 
 
600 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  26.63 
 
 
600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0767  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  31.57 
 
 
559 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  27.95 
 
 
647 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.3 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  45.91 
 
 
650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  43.91 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  27.83 
 
 
550 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.17 
 
 
582 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  29.35 
 
 
611 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.26 
 
 
595 aa  174  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.82 
 
 
1003 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  44.8 
 
 
600 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  29.04 
 
 
611 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  41.08 
 
 
1360 aa  172  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.65 
 
 
582 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30672  ATP-binding transporter  29.75 
 
 
828 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104543  normal  0.0203456 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.09 
 
 
572 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 
582 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  40.17 
 
 
1042 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 
582 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  26.64 
 
 
578 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  26.64 
 
 
578 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.81 
 
 
582 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  30.12 
 
 
625 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>