More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2559 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 		 595 aa  1176    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  99.66 
 
 		 618 aa  1173    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  90.22 
 
 		 616 aa  1047    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  44.71 
 
 		 603 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  32.59 
 
 		 599 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  31.28 
 
 		 594 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  32.52 
 
 		 597 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  31.87 
 
 		 586 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  33.19 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  31.92 
 
 		 606 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 613 aa  227  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  28.28 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  26.99 
 
 		 676 aa  217  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  30.98 
 
 		 571 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  32.3 
 
 		 574 aa  212  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  27.63 
 
 		 602 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  29.82 
 
 		 600 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  25.97 
 
 		 608 aa  200  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  36.12 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  30.72 
 
 		 609 aa  198  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  48.61 
 
 		 589 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  33.62 
 
 		 625 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  31.81 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  29.29 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  31.95 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.82 
 
 		 720 aa  194  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  29.56 
 
 		 577 aa  194  6e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  33.25 
 
 		 627 aa  193  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  30.61 
 
 		 720 aa  193  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  41.77 
 
 		 600 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 		 616 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  27.02 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 598 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.72 
 
 		 739 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  28.92 
 
 		 613 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.42 
 
 		 1024 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  29.71 
 
 		 593 aa  191  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  28.9 
 
 		 749 aa  191  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  27.89 
 
 		 592 aa  191  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.32 
 
 		 1008 aa  190  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.32 
 
 		 1008 aa  190  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  32.61 
 
 		 728 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.43 
 
 		 1003 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  35.55 
 
 		 1436 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  27.53 
 
 		 600 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  31.7 
 
 		 640 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  40.5 
 
 		 606 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.56 
 
 		 567 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  27.74 
 
 		 590 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  33.94 
 
 		 1231 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.97 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.59 
 
 		 591 aa  187  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.97 
 
 		 578 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  31.89 
 
 		 597 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  45.02 
 
 		 585 aa  187  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  45.02 
 
 		 577 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.38 
 
 		 564 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  44.34 
 
 		 596 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  30.48 
 
 		 725 aa  186  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.34 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  46.08 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.33 
 
 		 567 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.27 
 
 		 728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  45.53 
 
 		 605 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  32.65 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  44.87 
 
 		 652 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3546  ABC transporter related  45.15 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.73 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.8 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.8 
 
 		 591 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.97 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0691  ABC transporter ATP-binding protein  29.18 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.53 
 
 		 741 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  43.67 
 
 		 610 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  47.8 
 
 		 552 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.44 
 
 		 712 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  43.04 
 
 		 746 aa  183  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  27.84 
 
 		 468 aa  184  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.78 
 
 		 611 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5449  ABC transporter related  39.13 
 
 		 622 aa  183  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.89957  normal  0.0448259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  40.16 
 
 		 610 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.63 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.21 
 
 		 564 aa  183  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  40.42 
 
 		 595 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  29.76 
 
 		 612 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  33 
 
 		 603 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.14 
 
 		 611 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  38.46 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  29.81 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  40.32 
 
 		 606 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  37.83 
 
 		 612 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.83 
 
 		 611 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  30.56 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.5 
 
 		 601 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.23 
 
 		 1012 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0953  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  40.87 
 
 		 669 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  30.67 
 
 		 586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  30.68 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2516  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 610 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>