More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2750 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1153    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  52.87 
 
 		 586 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  47.47 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  44.5 
 
 		 571 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  34.44 
 
 		 603 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  28.15 
 
 		 599 aa  236  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  29.55 
 
 		 594 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.76 
 
 		 595 aa  229  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  32.76 
 
 		 618 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  30.29 
 
 		 587 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  32.61 
 
 		 616 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  29.78 
 
 		 597 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.42 
 
 		 564 aa  213  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.74 
 
 		 564 aa  209  8e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  31.4 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.7 
 
 		 598 aa  208  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.69 
 
 		 581 aa  207  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.48 
 
 		 564 aa  206  9e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.75 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  30.33 
 
 		 749 aa  203  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  29.78 
 
 		 606 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  28.01 
 
 		 634 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.16 
 
 		 583 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  26.81 
 
 		 613 aa  199  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  26.82 
 
 		 676 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.51 
 
 		 976 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.91 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.48 
 
 		 556 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.04 
 
 		 576 aa  198  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  30.97 
 
 		 611 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  30.75 
 
 		 611 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  30.78 
 
 		 611 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  29.8 
 
 		 613 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 		 600 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  37.29 
 
 		 705 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  27.85 
 
 		 746 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 1000 aa  195  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  31.63 
 
 		 971 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  30.19 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  26.79 
 
 		 600 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  32.56 
 
 		 975 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.76 
 
 		 580 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.87 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.86 
 
 		 930 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  29.2 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.08 
 
 		 639 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.42 
 
 		 611 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.15 
 
 		 1003 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.29 
 
 		 574 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.82 
 
 		 574 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  28.6 
 
 		 647 aa  191  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.87 
 
 		 592 aa  190  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  27.48 
 
 		 578 aa  189  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  27.48 
 
 		 578 aa  189  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.45 
 
 		 1024 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.91 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.96 
 
 		 1001 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.91 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  28.2 
 
 		 599 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  28.49 
 
 		 613 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  30.74 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  29.98 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  29.77 
 
 		 601 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.18 
 
 		 591 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.43 
 
 		 582 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  29.57 
 
 		 612 aa  187  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.62 
 
 		 579 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  44.8 
 
 		 731 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  30.32 
 
 		 607 aa  186  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  30.64 
 
 		 571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 620 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  28.03 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.59 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  27.73 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  31.14 
 
 		 622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.88 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  29.39 
 
 		 612 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  29.98 
 
 		 588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  43.44 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33.88 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  28.07 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  28.03 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  30.46 
 
 		 592 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1240  hypothetical protein  28.89 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.96 
 
 		 587 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.43 
 
 		 583 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.07 
 
 		 595 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1240  hypothetical protein  27.24 
 
 		 603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.71 
 
 		 602 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  42.53 
 
 		 589 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.99 
 
 		 588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  29.82 
 
 		 607 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  29.35 
 
 		 596 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  32.05 
 
 		 610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  29.69 
 
 		 600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.88 
 
 		 582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32 
 
 		 590 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>