More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1147 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  98.23 
 
 
564 aa  1102    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  66.96 
 
 
564 aa  773    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  97.7 
 
 
564 aa  1082    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 
564 aa  1118    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  31.27 
 
 
600 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  32.64 
 
 
614 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  30.82 
 
 
594 aa  296  9e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  31.37 
 
 
611 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  28.45 
 
 
625 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  30.43 
 
 
600 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  30.41 
 
 
583 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  28 
 
 
605 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  28.67 
 
 
603 aa  265  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  27.13 
 
 
596 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  27.66 
 
 
586 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  29.48 
 
 
583 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 
599 aa  257  3e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  28.28 
 
 
628 aa  256  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  30.99 
 
 
610 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  26.82 
 
 
596 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  30.29 
 
 
599 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  27.51 
 
 
571 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  27.69 
 
 
585 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  28.6 
 
 
568 aa  240  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  31.09 
 
 
599 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  28.33 
 
 
613 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  28.12 
 
 
613 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.85 
 
 
587 aa  219  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  29.34 
 
 
603 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.16 
 
 
594 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.57 
 
 
573 aa  217  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  30.08 
 
 
556 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3407  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.74 
 
 
600 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.830424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29 
 
 
575 aa  216  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  30.89 
 
 
606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.47 
 
 
601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.73 
 
 
589 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.21 
 
 
574 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.21 
 
 
574 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  29.93 
 
 
613 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.35 
 
 
601 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  26.84 
 
 
606 aa  213  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.11 
 
 
594 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.36 
 
 
590 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  28.6 
 
 
603 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  29.15 
 
 
572 aa  211  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.29 
 
 
587 aa  210  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.69 
 
 
575 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  29.04 
 
 
586 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  30.45 
 
 
676 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.91 
 
 
594 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  28.77 
 
 
611 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  28.45 
 
 
603 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  27.78 
 
 
607 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  33.23 
 
 
610 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  28.6 
 
 
592 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  26.51 
 
 
600 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.93 
 
 
609 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  30.68 
 
 
597 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.29 
 
 
605 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  28.57 
 
 
611 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  30.33 
 
 
574 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.56 
 
 
593 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
578 aa  207  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  27.6 
 
 
616 aa  206  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.74 
 
 
586 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  27.72 
 
 
610 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  29.85 
 
 
613 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  26.98 
 
 
599 aa  206  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  27.67 
 
 
610 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  29.86 
 
 
586 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
571 aa  205  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  27.93 
 
 
552 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  37.14 
 
 
589 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  30.36 
 
 
581 aa  203  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.26 
 
 
578 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.26 
 
 
578 aa  203  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.02 
 
 
592 aa  203  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.46 
 
 
600 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.37 
 
 
583 aa  203  7e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 
566 aa  203  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  29.22 
 
 
578 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.28 
 
 
587 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.53 
 
 
612 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  27.87 
 
 
566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  33.99 
 
 
626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.37 
 
 
759 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  29.72 
 
 
580 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  32.55 
 
 
613 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  29.72 
 
 
580 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.45 
 
 
624 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.84 
 
 
574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.38 
 
 
591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.84 
 
 
574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  28.46 
 
 
578 aa  200  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.84 
 
 
575 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.84 
 
 
575 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  29.71 
 
 
650 aa  200  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.84 
 
 
575 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.84 
 
 
596 aa  200  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>