More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3683 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3683  ATPase  100 
 
 		 603 aa  1213    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  37.15 
 
 		 610 aa  350  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  32.78 
 
 		 607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  32.35 
 
 		 600 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  32.42 
 
 		 611 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 		 599 aa  244  5e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 594 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  30.1 
 
 		 600 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  30.56 
 
 		 614 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  31.83 
 
 		 586 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  33.97 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  35.2 
 
 		 583 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  31.07 
 
 		 605 aa  225  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  33.55 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  31.44 
 
 		 606 aa  222  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  28.52 
 
 		 625 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  33.17 
 
 		 603 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  29.09 
 
 		 613 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  30.2 
 
 		 583 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  30.45 
 
 		 600 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  28.47 
 
 		 571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  32.46 
 
 		 599 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  32.59 
 
 		 628 aa  213  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  31.58 
 
 		 585 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.12 
 
 		 564 aa  211  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  30.84 
 
 		 568 aa  210  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.8 
 
 		 564 aa  208  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  32.31 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  31.36 
 
 		 626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  27.13 
 
 		 700 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  27.56 
 
 		 930 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  32.58 
 
 		 651 aa  196  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 564 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  29.93 
 
 		 699 aa  195  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.19 
 
 		 564 aa  193  6e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.18 
 
 		 581 aa  193  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.53 
 
 		 583 aa  193  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  31.44 
 
 		 599 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.14 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  43.98 
 
 		 740 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.26 
 
 		 741 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.17 
 
 		 1024 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  30.13 
 
 		 601 aa  191  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.89 
 
 		 739 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  29.26 
 
 		 586 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 		 601 aa  190  8e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  26.38 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1058  RtxB protein  41.42 
 
 		 368 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.44 
 
 		 712 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.06 
 
 		 1001 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  39.84 
 
 		 595 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  36.76 
 
 		 585 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  34.02 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1819  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.4 
 
 		 604 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.372613  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  38.19 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.09 
 
 		 999 aa  185  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.71 
 
 		 1019 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.23 
 
 		 726 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  28.19 
 
 		 604 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  28.54 
 
 		 706 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.42 
 
 		 602 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  29.34 
 
 		 721 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  29.49 
 
 		 975 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  29.31 
 
 		 720 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  27.73 
 
 		 638 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  32.86 
 
 		 606 aa  183  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.18 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.98 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.45 
 
 		 1008 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  27.27 
 
 		 579 aa  183  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.45 
 
 		 1008 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.33 
 
 		 586 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  28.6 
 
 		 764 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.23 
 
 		 1003 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.47 
 
 		 1000 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  32.23 
 
 		 569 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  28.76 
 
 		 773 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.86 
 
 		 976 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  36.73 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 586 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  37.78 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.8 
 
 		 720 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  31.41 
 
 		 612 aa  180  7e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  28.64 
 
 		 590 aa  180  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0580  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.71 
 
 		 571 aa  180  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.49 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.9 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  34.32 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.59 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  34.92 
 
 		 596 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  37.63 
 
 		 588 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.59 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.83 
 
 		 971 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  37.59 
 
 		 582 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.72 
 
 		 582 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.01 
 
 		 586 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.72 
 
 		 582 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.62 
 
 		 738 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  38.72 
 
 		 582 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>