More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0410 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  100 
 
 
610 aa  1248    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  37.52 
 
 
603 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  35.04 
 
 
607 aa  343  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  33.9 
 
 
594 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  32.94 
 
 
611 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  29.8 
 
 
625 aa  256  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  30.12 
 
 
613 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  30.77 
 
 
600 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  29.89 
 
 
614 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  30.74 
 
 
571 aa  243  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  30.5 
 
 
586 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  30.5 
 
 
596 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  31.11 
 
 
596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  30.48 
 
 
583 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  30.89 
 
 
583 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 
599 aa  224  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  29.4 
 
 
564 aa  223  8e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  29.57 
 
 
605 aa  223  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  30.29 
 
 
600 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  31.27 
 
 
603 aa  219  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  32.75 
 
 
599 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  27.24 
 
 
599 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 
564 aa  209  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  29.92 
 
 
585 aa  208  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  26.09 
 
 
552 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  30.39 
 
 
610 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  28.16 
 
 
610 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
564 aa  205  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  25.48 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  30.62 
 
 
606 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  39.94 
 
 
626 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  30.24 
 
 
628 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.32 
 
 
601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  26.35 
 
 
601 aa  197  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  29.63 
 
 
568 aa  196  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  28.47 
 
 
594 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.55 
 
 
582 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.6 
 
 
582 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  25.29 
 
 
586 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  27.51 
 
 
611 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.55 
 
 
600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  27.41 
 
 
576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  27.14 
 
 
611 aa  185  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.5 
 
 
582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.44 
 
 
587 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.88 
 
 
600 aa  183  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  37.31 
 
 
699 aa  183  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  26.85 
 
 
572 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  36.33 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.46 
 
 
607 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  31.84 
 
 
585 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  29.04 
 
 
728 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  31.35 
 
 
601 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.77 
 
 
588 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.33 
 
 
724 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  28.33 
 
 
724 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.25 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.25 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.25 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.47 
 
 
705 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  34.56 
 
 
589 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.29 
 
 
587 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.25 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  40.25 
 
 
582 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  31.66 
 
 
600 aa  179  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1819  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.74 
 
 
604 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.372613  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  34.69 
 
 
613 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.35 
 
 
601 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.35 
 
 
601 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.09 
 
 
600 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  28.15 
 
 
604 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.44 
 
 
594 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  36.79 
 
 
700 aa  178  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  41.1 
 
 
582 aa  178  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25.48 
 
 
610 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.85 
 
 
608 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.84 
 
 
582 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  39.5 
 
 
582 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.65 
 
 
579 aa  177  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  33.74 
 
 
589 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.64 
 
 
600 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.26 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  32.4 
 
 
607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  28.79 
 
 
731 aa  176  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  33.69 
 
 
759 aa  175  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.71 
 
 
574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  29.83 
 
 
600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2828  ABC transporter, ATPase subunit  30.04 
 
 
618 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  29.35 
 
 
607 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  36.73 
 
 
706 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  30.09 
 
 
618 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>