More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2654 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  74.83 
 
 		 585 aa  800    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  91.3 
 
 		 586 aa  978    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1150    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  73.01 
 
 		 585 aa  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  75.69 
 
 		 583 aa  755    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  91.44 
 
 		 596 aa  996    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  43.79 
 
 		 600 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 611 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 599 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  39.5 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  41.74 
 
 		 628 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  41.31 
 
 		 605 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  39.41 
 
 		 600 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  38.8 
 
 		 625 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  39.93 
 
 		 603 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.88 
 
 		 599 aa  369  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  39.51 
 
 		 568 aa  359  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  35.1 
 
 		 614 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  32.87 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  34.3 
 
 		 600 aa  298  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  31.96 
 
 		 571 aa  276  9e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  35.07 
 
 		 613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.69 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.09 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  29.35 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.9 
 
 		 564 aa  260  6e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  39 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  28.62 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.12 
 
 		 564 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  27.45 
 
 		 564 aa  253  7e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.26 
 
 		 564 aa  252  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  26.23 
 
 		 552 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  29.7 
 
 		 610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  34.16 
 
 		 606 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  31.59 
 
 		 603 aa  232  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  27.44 
 
 		 576 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  30.93 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  27.84 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  28.18 
 
 		 611 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  30.4 
 
 		 610 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  29.15 
 
 		 613 aa  223  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  33.74 
 
 		 613 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  31.26 
 
 		 612 aa  217  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  29.91 
 
 		 592 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.93 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.54 
 
 		 586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.99 
 
 		 582 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 575 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  48.23 
 
 		 591 aa  213  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.05 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.05 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.05 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.05 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.05 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  28.33 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  30.57 
 
 		 600 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  32.61 
 
 		 605 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 596 aa  210  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.42 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 582 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.42 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.45 
 
 		 582 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  40.7 
 
 		 603 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  30.82 
 
 		 604 aa  206  8e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  38.22 
 
 		 601 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.37 
 
 		 976 aa  205  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  45.04 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.69 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  34.76 
 
 		 625 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  42.76 
 
 		 971 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.22 
 
 		 597 aa  203  7e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  46.26 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  46.26 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 720 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  42.46 
 
 		 595 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  42.99 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  42.73 
 
 		 727 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  46.35 
 
 		 582 aa  200  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  46.9 
 
 		 601 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  44.72 
 
 		 607 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  48.09 
 
 		 720 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.51 
 
 		 600 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  39.44 
 
 		 612 aa  197  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  41.25 
 
 		 594 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  37.97 
 
 		 1042 aa  196  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  44.76 
 
 		 610 aa  196  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  42.91 
 
 		 975 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0733  ABC transporter related  43.7 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0762  ABC transporter related  43.7 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>