More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2121 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  100 
 
 		 592 aa  1201    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  33.22 
 
 		 610 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  34.95 
 
 		 606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  32.83 
 
 		 676 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  32.33 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  30.98 
 
 		 608 aa  264  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  35.43 
 
 		 610 aa  263  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  33.48 
 
 		 600 aa  262  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  43.13 
 
 		 746 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  34.48 
 
 		 649 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 613 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  31.85 
 
 		 609 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.19 
 
 		 618 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  35.15 
 
 		 634 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  33.22 
 
 		 609 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  32.22 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  32.64 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  51.38 
 
 		 641 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  33.8 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.99 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  31.48 
 
 		 611 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.14 
 
 		 611 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.82 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.67 
 
 		 596 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.82 
 
 		 591 aa  247  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  31.2 
 
 		 611 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 598 aa  246  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.79 
 
 		 584 aa  246  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  34.52 
 
 		 632 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  34.44 
 
 		 600 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.88 
 
 		 578 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  32.86 
 
 		 624 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.88 
 
 		 578 aa  244  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.48 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.62 
 
 		 573 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  32.44 
 
 		 595 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  32.18 
 
 		 599 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  29.67 
 
 		 603 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  48.54 
 
 		 593 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  29.39 
 
 		 612 aa  243  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  29.77 
 
 		 593 aa  242  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  29.49 
 
 		 616 aa  242  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  34.1 
 
 		 609 aa  243  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.97 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  31.41 
 
 		 777 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.23 
 
 		 577 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.42 
 
 		 600 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  34.09 
 
 		 590 aa  240  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.6 
 
 		 598 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.71 
 
 		 586 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.46 
 
 		 586 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 		 586 aa  240  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.67 
 
 		 587 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.16 
 
 		 566 aa  239  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  28.24 
 
 		 638 aa  239  9e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 566 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  31.82 
 
 		 595 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  48.16 
 
 		 749 aa  239  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.29 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.96 
 
 		 602 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  34.54 
 
 		 603 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  30.29 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.29 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  30.07 
 
 		 602 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 582 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  49.58 
 
 		 601 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  54.71 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  49.58 
 
 		 601 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  48.61 
 
 		 582 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.51 
 
 		 578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  31.74 
 
 		 601 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.79 
 
 		 602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.79 
 
 		 602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.79 
 
 		 602 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.98 
 
 		 586 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  31.3 
 
 		 726 aa  237  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  34.8 
 
 		 731 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.91 
 
 		 597 aa  236  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.84 
 
 		 577 aa  236  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  50.21 
 
 		 597 aa  236  9e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  34 
 
 		 770 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  34 
 
 		 750 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 613 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  46.61 
 
 		 750 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.53 
 
 		 582 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  33.82 
 
 		 601 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>