More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0152 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  100 
 
 
602 aa  1219    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  62.02 
 
 
600 aa  772    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  28.55 
 
 
606 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  29.84 
 
 
597 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  27.67 
 
 
609 aa  245  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  30.68 
 
 
613 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  29.09 
 
 
613 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.24 
 
 
586 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  27.29 
 
 
600 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  31.3 
 
 
649 aa  242  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  27.78 
 
 
676 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  31.15 
 
 
634 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  30.96 
 
 
592 aa  236  8e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.29 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  26.83 
 
 
749 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  30.05 
 
 
627 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  27.21 
 
 
746 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.54 
 
 
592 aa  233  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.19 
 
 
639 aa  233  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.18 
 
 
583 aa  233  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  30.71 
 
 
647 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.51 
 
 
579 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.17 
 
 
590 aa  231  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.04 
 
 
605 aa  230  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  30.22 
 
 
632 aa  229  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  29.18 
 
 
616 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  29.32 
 
 
608 aa  228  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.82 
 
 
589 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.36 
 
 
582 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.52 
 
 
579 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.73 
 
 
572 aa  227  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.25 
 
 
578 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.25 
 
 
578 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1064  ABC transporter, transmembrane region  29.71 
 
 
602 aa  226  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.415501  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  28.37 
 
 
609 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  29.65 
 
 
632 aa  226  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.12 
 
 
592 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.48 
 
 
597 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  39.41 
 
 
606 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4514  ABC transporter related  30.53 
 
 
600 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.350646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.79 
 
 
632 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 
616 aa  224  4e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  31.39 
 
 
641 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.21 
 
 
574 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.21 
 
 
574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.5 
 
 
600 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0218  ABC transporter related  30.21 
 
 
603 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.045822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  30.07 
 
 
619 aa  223  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  34.28 
 
 
629 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  29.42 
 
 
605 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  26.69 
 
 
588 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29 
 
 
606 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  29.98 
 
 
618 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  30.06 
 
 
600 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5675  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.37 
 
 
601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400511  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31 
 
 
641 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.58 
 
 
578 aa  220  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  32.3 
 
 
601 aa  220  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.41 
 
 
585 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  32.29 
 
 
619 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.03 
 
 
594 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  34.32 
 
 
606 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.76 
 
 
596 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  30.63 
 
 
651 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.41 
 
 
600 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  28.82 
 
 
584 aa  219  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.06 
 
 
598 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.8 
 
 
596 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  29.38 
 
 
594 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  29.71 
 
 
600 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  28.71 
 
 
611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  36.19 
 
 
597 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.46 
 
 
583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  27 
 
 
599 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  38.28 
 
 
634 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.54 
 
 
593 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.21 
 
 
576 aa  218  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.15 
 
 
587 aa  218  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  35.06 
 
 
595 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 
575 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  34.23 
 
 
590 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 
574 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 
575 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 
596 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 
596 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.57 
 
 
575 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 
574 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  29.8 
 
 
634 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  42.63 
 
 
661 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.28 
 
 
597 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.07 
 
 
582 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  26.26 
 
 
600 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 
588 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  41.07 
 
 
1179 aa  216  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  38.85 
 
 
571 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  27.59 
 
 
601 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  39.23 
 
 
579 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  29.1 
 
 
600 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  28.74 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.94 
 
 
602 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>