More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0168 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  70.27 
 
 
605 aa  843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  79.54 
 
 
613 aa  980    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  100 
 
 
612 aa  1228    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  41.27 
 
 
610 aa  475  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  39.8 
 
 
611 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  40.23 
 
 
611 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  34.54 
 
 
600 aa  273  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  30.57 
 
 
600 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  31.49 
 
 
611 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  32.46 
 
 
625 aa  252  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  29.71 
 
 
571 aa  250  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  32.3 
 
 
603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  36.2 
 
 
583 aa  240  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  31.76 
 
 
613 aa  236  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.72 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  31.13 
 
 
605 aa  231  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  30.56 
 
 
599 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  31.75 
 
 
586 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  31.75 
 
 
596 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  30.9 
 
 
583 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  28.21 
 
 
576 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  34.74 
 
 
600 aa  218  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  30.81 
 
 
596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  29.57 
 
 
552 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.63 
 
 
583 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  30.29 
 
 
568 aa  213  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  29.39 
 
 
614 aa  212  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  28.96 
 
 
594 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.91 
 
 
597 aa  211  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.29 
 
 
600 aa  210  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  28.87 
 
 
626 aa  210  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  29.18 
 
 
585 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  29.6 
 
 
575 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  38.51 
 
 
626 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.06 
 
 
588 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.75 
 
 
597 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  28.08 
 
 
599 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.71 
 
 
583 aa  206  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.19 
 
 
590 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.15 
 
 
582 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0939  ABC transporter-related protein  29.67 
 
 
590 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0988  ABC transporter related  32.3 
 
 
591 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.026388 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.32 
 
 
564 aa  204  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.7 
 
 
611 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.8 
 
 
597 aa  203  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.22 
 
 
582 aa  203  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  29.77 
 
 
618 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.19 
 
 
582 aa  203  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.51 
 
 
597 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.17 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.69 
 
 
593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.55 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.61 
 
 
589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.69 
 
 
583 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  30.18 
 
 
599 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.11 
 
 
586 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  29.12 
 
 
613 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  28.76 
 
 
628 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  29.7 
 
 
571 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  29.29 
 
 
601 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.47 
 
 
583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  29.65 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.38 
 
 
581 aa  200  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.96 
 
 
582 aa  200  5e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.52 
 
 
641 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.52 
 
 
632 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.38 
 
 
596 aa  200  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.67 
 
 
583 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  28.7 
 
 
611 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.74 
 
 
594 aa  200  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  29.98 
 
 
591 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.67 
 
 
593 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  29.36 
 
 
601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  28.98 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.6 
 
 
594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.85 
 
 
623 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.31 
 
 
594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  28.98 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  28.01 
 
 
604 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.33 
 
 
583 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.64 
 
 
634 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.2 
 
 
603 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  27.55 
 
 
612 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2422  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.96 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2492  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.96 
 
 
601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677361  normal  0.121232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1819  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.54 
 
 
604 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.372613  normal  0.63467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.65 
 
 
556 aa  198  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.16 
 
 
602 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  28.33 
 
 
611 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  29.01 
 
 
601 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  30.82 
 
 
597 aa  198  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.82 
 
 
579 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.22 
 
 
587 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.81 
 
 
598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  27.39 
 
 
586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.16 
 
 
602 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.54 
 
 
594 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.16 
 
 
602 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.61 
 
 
600 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.16 
 
 
602 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>