More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3057 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  100 
 
 		 571 aa  1118    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  48.14 
 
 		 586 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  44.88 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  44.5 
 
 		 574 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  34.92 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  29.26 
 
 		 599 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  32.33 
 
 		 618 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.33 
 
 		 595 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  32.02 
 
 		 616 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  29.43 
 
 		 606 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  29.64 
 
 		 594 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  25.65 
 
 		 564 aa  203  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  30.91 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  30 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.75 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.27 
 
 		 574 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.18 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  28.9 
 
 		 597 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  24.53 
 
 		 600 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.62 
 
 		 596 aa  191  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.62 
 
 		 596 aa  191  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.62 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.62 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.62 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.62 
 
 		 574 aa  190  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.62 
 
 		 574 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  28.99 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.31 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  27.31 
 
 		 609 aa  187  6e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  27.48 
 
 		 600 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.43 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  30.04 
 
 		 639 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  42.54 
 
 		 596 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  28.88 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.93 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  29.74 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  29.87 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.09 
 
 		 600 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  43.15 
 
 		 586 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 613 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.1 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  29.98 
 
 		 580 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  27.55 
 
 		 627 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  43.18 
 
 		 589 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  32.72 
 
 		 625 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  24.91 
 
 		 602 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  28.29 
 
 		 634 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  28.49 
 
 		 647 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.84 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  42.11 
 
 		 606 aa  173  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.98 
 
 		 581 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.87 
 
 		 577 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  32.22 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.02 
 
 		 581 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  47 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.56 
 
 		 592 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  27.85 
 
 		 578 aa  172  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  38.2 
 
 		 584 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  36.59 
 
 		 610 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  28.81 
 
 		 585 aa  170  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  25.64 
 
 		 676 aa  170  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  42.53 
 
 		 585 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  29.74 
 
 		 575 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3240  ABC transporter related  31.86 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.25 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.57 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  29.1 
 
 		 580 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  26.02 
 
 		 585 aa  168  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30 
 
 		 586 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.28 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  27.73 
 
 		 632 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  28.7 
 
 		 613 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  42.36 
 
 		 595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  28.67 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.49 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  27.66 
 
 		 749 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.36 
 
 		 594 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 620 aa  167  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  40.65 
 
 		 583 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 571 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.96 
 
 		 582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  27.99 
 
 		 612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  26.98 
 
 		 573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.34 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.91 
 
 		 567 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.96 
 
 		 571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  26.63 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.48 
 
 		 597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  28.31 
 
 		 634 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  29.31 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  28.74 
 
 		 611 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  27.54 
 
 		 577 aa  165  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.95 
 
 		 594 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.86 
 
 		 583 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  29.01 
 
 		 586 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  27.56 
 
 		 614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  28.21 
 
 		 568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  41.28 
 
 		 600 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>