More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3240 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3240  ABC transporter related  100 
 
 
567 aa  1110    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  34.09 
 
 
603 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  29.67 
 
 
599 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  28.38 
 
 
564 aa  213  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  30.98 
 
 
586 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.21 
 
 
595 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  31.19 
 
 
613 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  31.93 
 
 
571 aa  203  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  32.01 
 
 
618 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  31.41 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  31.78 
 
 
616 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  26.73 
 
 
676 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  32.08 
 
 
625 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.09 
 
 
564 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.63 
 
 
597 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  29.39 
 
 
582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.77 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.05 
 
 
582 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  32.39 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.86 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.86 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  29.94 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.86 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  26.67 
 
 
583 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.44 
 
 
582 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.4 
 
 
582 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.91 
 
 
564 aa  181  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  29.19 
 
 
587 aa  181  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  27.51 
 
 
594 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  26.4 
 
 
602 aa  180  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.13 
 
 
583 aa  179  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.51 
 
 
600 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.73 
 
 
564 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  30.91 
 
 
569 aa  179  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.75 
 
 
582 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  23.53 
 
 
564 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.92 
 
 
582 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  32.62 
 
 
603 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.69 
 
 
581 aa  174  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  29.47 
 
 
603 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  30.41 
 
 
610 aa  173  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  27.16 
 
 
599 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.18 
 
 
592 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.87 
 
 
582 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.3 
 
 
603 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  29.2 
 
 
611 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.51 
 
 
602 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  37.55 
 
 
727 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  27.32 
 
 
582 aa  171  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  29.92 
 
 
600 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  41.87 
 
 
584 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.48 
 
 
582 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  26.78 
 
 
627 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  27.36 
 
 
606 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  39.64 
 
 
596 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  27.61 
 
 
600 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  28.4 
 
 
603 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.91 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  43.19 
 
 
552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.36 
 
 
602 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  38.19 
 
 
585 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.69 
 
 
593 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1714  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  45.85 
 
 
569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.16 
 
 
602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.04 
 
 
607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  28.68 
 
 
576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  36.27 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  30.63 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  41.52 
 
 
589 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  29.32 
 
 
568 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  32.38 
 
 
628 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.83 
 
 
583 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  28.25 
 
 
613 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.77 
 
 
600 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.15 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  37.64 
 
 
605 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 
592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2774  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  24.6 
 
 
590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.41147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  28.48 
 
 
651 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4843  ABC transporter related  31.85 
 
 
605 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.929922  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.02 
 
 
613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  23.94 
 
 
577 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  23.94 
 
 
577 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  41.1 
 
 
782 aa  163  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  25.27 
 
 
749 aa  163  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  38.02 
 
 
606 aa  163  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  28.54 
 
 
600 aa  163  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>