More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44230  ABC transporter protein  100 
 
 		 586 aa  1165    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1174  ABC transporter related  54.29 
 
 		 587 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2750  ABC transporter related  52.87 
 
 		 574 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0986364  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3057  ABC transporter related  48.14 
 
 		 571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539109  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2559  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.68 
 
 		 595 aa  238  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.864708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1218  ABC transporter related  32.68 
 
 		 618 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0802888  normal  0.120203 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3381  ABC transporter related  29.28 
 
 		 599 aa  236  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0477637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4550  ABC transporter related  32.2 
 
 		 603 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1963  ABC transporter related  32.3 
 
 		 616 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.220325  normal  0.545041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  31.65 
 
 		 587 aa  220  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4682  ABC transporter related  30.77 
 
 		 597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582137  normal  0.306509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  28.98 
 
 		 606 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3988  ABC transporter related  31.58 
 
 		 597 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  28.26 
 
 		 676 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2900  ABC transporter-like protein protein  28.55 
 
 		 749 aa  208  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0999643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  29.05 
 
 		 594 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  31.88 
 
 		 600 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  28.31 
 
 		 613 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  29.11 
 
 		 639 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  28.32 
 
 		 746 aa  203  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  28.52 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.16 
 
 		 580 aa  200  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  25.85 
 
 		 600 aa  199  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  25.3 
 
 		 612 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.08 
 
 		 564 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  31.23 
 
 		 601 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  31.23 
 
 		 601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.49 
 
 		 579 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.11 
 
 		 598 aa  196  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  28.97 
 
 		 980 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  32.22 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  27.57 
 
 		 577 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  27.57 
 
 		 577 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  29.55 
 
 		 613 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  30.68 
 
 		 600 aa  193  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  31.16 
 
 		 611 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2662  ABC transporter ATPase and inner membrane protein  30.4 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564028  decreased coverage  0.00171359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  29.2 
 
 		 613 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  29.52 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.46 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.81 
 
 		 611 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  30.9 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  29.25 
 
 		 590 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  27.07 
 
 		 609 aa  191  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  26.87 
 
 		 611 aa  190  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  32.48 
 
 		 611 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  28.31 
 
 		 647 aa  190  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  26.72 
 
 		 632 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.48 
 
 		 768 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.17 
 
 		 556 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.87 
 
 		 705 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3240  ABC transporter related  31.62 
 
 		 567 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.28 
 
 		 564 aa  189  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  29.92 
 
 		 649 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0705  ABC transporter-related protein  31.42 
 
 		 784 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  29.8 
 
 		 930 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.67 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.9 
 
 		 564 aa  187  5e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.67 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.18 
 
 		 591 aa  187  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.41 
 
 		 636 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  27.39 
 
 		 582 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  30.13 
 
 		 576 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.54 
 
 		 582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  32.08 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  28.29 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  34.12 
 
 		 614 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  30.19 
 
 		 627 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.23 
 
 		 582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.97 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.72 
 
 		 590 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  30.1 
 
 		 572 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.44 
 
 		 574 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  28.71 
 
 		 582 aa  184  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.67 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  29.17 
 
 		 550 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.6 
 
 		 577 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  44.68 
 
 		 583 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  28.7 
 
 		 598 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  27.51 
 
 		 564 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  31 
 
 		 610 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.04 
 
 		 576 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.23 
 
 		 574 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  44.44 
 
 		 739 aa  183  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  28.97 
 
 		 588 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  27.07 
 
 		 600 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  28.65 
 
 		 613 aa  183  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.57 
 
 		 597 aa  183  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  30.3 
 
 		 592 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.65 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  44.11 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30.79 
 
 		 603 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  27.07 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.47 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  30.17 
 
 		 814 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5374  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  32.77 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.33633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9257  ABCB8; ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8  45.61 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  44.11 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  26.97 
 
 		 607 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>