More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21548 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  100 
 
 		 1360 aa  2795    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48483  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  33.77 
 
 		 1250 aa  326  1e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  33.59 
 
 		 1408 aa  325  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  32.67 
 
 		 1343 aa  323  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  30.65 
 
 		 1266 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  31.07 
 
 		 1284 aa  288  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 		 606 aa  275  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  51.2 
 
 		 581 aa  271  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  32.24 
 
 		 603 aa  271  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  30.11 
 
 		 646 aa  266  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 601 aa  265  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  32.07 
 
 		 586 aa  263  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  33.06 
 
 		 607 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  31.53 
 
 		 614 aa  262  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  47.04 
 
 		 556 aa  259  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00404  AtrH [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2VY21]  28.31 
 
 		 1324 aa  259  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.173354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  30.69 
 
 		 613 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  31.8 
 
 		 1323 aa  258  7e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.33 
 
 		 594 aa  255  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 623 aa  254  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 601 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.03 
 
 		 596 aa  252  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  52.38 
 
 		 579 aa  252  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.45 
 
 		 782 aa  251  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.44 
 
 		 608 aa  250  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.1 
 
 		 582 aa  250  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  51 
 
 		 645 aa  249  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  50 
 
 		 598 aa  249  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  37.23 
 
 		 596 aa  249  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.83 
 
 		 580 aa  249  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  32.23 
 
 		 598 aa  247  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  53.09 
 
 		 585 aa  247  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  51.69 
 
 		 612 aa  247  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  50.41 
 
 		 608 aa  246  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  52.78 
 
 		 601 aa  246  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.23 
 
 		 608 aa  245  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.44 
 
 		 597 aa  245  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  51.04 
 
 		 610 aa  245  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.93 
 
 		 1377 aa  244  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.33 
 
 		 586 aa  244  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.74 
 
 		 619 aa  243  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  51.19 
 
 		 636 aa  243  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 611 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.83 
 
 		 603 aa  243  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  50.81 
 
 		 611 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  46.86 
 
 		 614 aa  243  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  49.45 
 
 		 571 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.01 
 
 		 618 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  46.76 
 
 		 578 aa  242  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.32 
 
 		 596 aa  242  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  49.08 
 
 		 578 aa  242  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  49.08 
 
 		 578 aa  242  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.01 
 
 		 618 aa  241  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  30.85 
 
 		 594 aa  241  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  52.46 
 
 		 601 aa  240  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.73 
 
 		 589 aa  240  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29 
 
 		 579 aa  240  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  47.06 
 
 		 611 aa  239  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 		 619 aa  239  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 620 aa  239  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.76 
 
 		 597 aa  239  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  47.97 
 
 		 599 aa  239  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  32.67 
 
 		 606 aa  239  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  44.93 
 
 		 598 aa  238  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  31.47 
 
 		 583 aa  239  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.65 
 
 		 627 aa  238  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  33.39 
 
 		 597 aa  238  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.38 
 
 		 586 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  49.81 
 
 		 584 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0928  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.2 
 
 		 595 aa  238  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2254  ABC efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  49.8 
 
 		 578 aa  238  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  45.55 
 
 		 616 aa  238  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  30.29 
 
 		 597 aa  238  8e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2242  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  50.2 
 
 		 595 aa  238  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  29.62 
 
 		 639 aa  237  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  47.1 
 
 		 616 aa  237  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  46.21 
 
 		 622 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 		 586 aa  237  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.13 
 
 		 632 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.49 
 
 		 605 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  47.6 
 
 		 681 aa  236  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  52.42 
 
 		 600 aa  236  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.53 
 
 		 600 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.924491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.6 
 
 		 628 aa  236  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  52.4 
 
 		 601 aa  235  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  50.2 
 
 		 578 aa  235  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  49.59 
 
 		 611 aa  235  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  46.1 
 
 		 624 aa  235  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.37 
 
 		 566 aa  235  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  51.85 
 
 		 639 aa  235  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  48.76 
 
 		 631 aa  234  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  47.53 
 
 		 699 aa  234  6e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  31.72 
 
 		 597 aa  234  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  48.37 
 
 		 566 aa  234  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 613 aa  234  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  47.76 
 
 		 644 aa  234  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31.78 
 
 		 600 aa  233  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  45.16 
 
 		 632 aa  234  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1426  ABC transporter related  54.11 
 
 		 600 aa  233  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  48.86 
 
 		 613 aa  233  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>