More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_48483 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  34.76 
 
 
1343 aa  662    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  34.02 
 
 
1408 aa  659    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48483  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  100 
 
 
1250 aa  2533    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  32.07 
 
 
1266 aa  590  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  30.98 
 
 
1284 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  28.78 
 
 
1377 aa  484  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.57 
 
 
1323 aa  476  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00404  AtrH [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2VY21]  28.85 
 
 
1324 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.173354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  31.61 
 
 
1321 aa  359  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  30.85 
 
 
1264 aa  343  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  31.94 
 
 
1179 aa  334  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.94 
 
 
1179 aa  334  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  34.21 
 
 
1360 aa  333  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.66 
 
 
1179 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40758  ATP-dependent permease  25.88 
 
 
1197 aa  316  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00433632  normal  0.648895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  30.62 
 
 
1228 aa  306  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.97 
 
 
598 aa  305  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.4 
 
 
601 aa  296  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  38.21 
 
 
581 aa  295  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  36.65 
 
 
603 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  33.68 
 
 
645 aa  286  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  35.86 
 
 
614 aa  284  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
601 aa  281  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  35.82 
 
 
623 aa  280  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.94 
 
 
556 aa  277  9e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.18 
 
 
598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.52 
 
 
600 aa  273  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  271  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.69 
 
 
611 aa  271  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  34.26 
 
 
597 aa  270  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.14 
 
 
580 aa  270  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.33 
 
 
600 aa  268  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.96 
 
 
594 aa  266  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  32.66 
 
 
646 aa  266  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.97 
 
 
571 aa  265  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
575 aa  264  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  34.53 
 
 
634 aa  264  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.49 
 
 
597 aa  263  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  33.46 
 
 
586 aa  262  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  35.67 
 
 
611 aa  261  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.76 
 
 
608 aa  262  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.24 
 
 
598 aa  261  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  35.12 
 
 
578 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.14 
 
 
608 aa  261  5.0000000000000005e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  33.94 
 
 
578 aa  260  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  32.27 
 
 
610 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  28.24 
 
 
1138 aa  259  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 
596 aa  259  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  35.49 
 
 
611 aa  259  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  35.11 
 
 
641 aa  259  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.1 
 
 
782 aa  258  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.55 
 
 
597 aa  258  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  35.16 
 
 
606 aa  258  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  34.61 
 
 
632 aa  258  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  32.89 
 
 
596 aa  258  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  30.78 
 
 
582 aa  258  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.36 
 
 
619 aa  258  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.87 
 
 
617 aa  257  9e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.99 
 
 
583 aa  257  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.95 
 
 
641 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  32.69 
 
 
600 aa  256  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.67 
 
 
582 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
585 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.15 
 
 
611 aa  255  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.33 
 
 
583 aa  254  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.39 
 
 
606 aa  254  8.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 
616 aa  254  9.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.03 
 
 
579 aa  253  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  36.71 
 
 
634 aa  253  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.43 
 
 
616 aa  253  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  33.99 
 
 
578 aa  252  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  37.08 
 
 
468 aa  252  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.21 
 
 
632 aa  252  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
764 aa  252  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.59 
 
 
597 aa  252  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  32.78 
 
 
930 aa  252  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.06 
 
 
599 aa  251  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.93 
 
 
575 aa  251  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  32.83 
 
 
598 aa  251  8e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.26 
 
 
580 aa  251  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.36 
 
 
566 aa  251  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.07 
 
 
681 aa  251  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.92 
 
 
579 aa  250  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.45 
 
 
579 aa  250  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  33.66 
 
 
550 aa  250  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.23 
 
 
614 aa  250  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.16 
 
 
600 aa  249  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  33.27 
 
 
644 aa  249  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.52 
 
 
628 aa  249  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06436  ABC multidrug transporter (Eurofung)  41.38 
 
 
343 aa  249  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.402908  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1202  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.01 
 
 
608 aa  249  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  33.98 
 
 
647 aa  249  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.64 
 
 
639 aa  249  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.04 
 
 
566 aa  249  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.78 
 
 
608 aa  249  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  34.81 
 
 
649 aa  248  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.66 
 
 
598 aa  248  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  33.6 
 
 
601 aa  248  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.42 
 
 
636 aa  248  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.2 
 
 
602 aa  248  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>