More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07730 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.06 
 
 
1377 aa  691    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  37.58 
 
 
1266 aa  837    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  45.29 
 
 
1343 aa  1040    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  37.3 
 
 
1284 aa  777    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00404  AtrH [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2VY21]  34.84 
 
 
1324 aa  697    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.173354 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.56 
 
 
1323 aa  714    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48483  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  34.5 
 
 
1250 aa  652    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07730  multidrug resistance protein 1, putative  100 
 
 
1408 aa  2887    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04091  conserved hypothetical protein  34.32 
 
 
804 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  29.3 
 
 
1218 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
1194 aa  354  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  42.45 
 
 
581 aa  352  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18473  predicted protein  39.56 
 
 
645 aa  349  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  28.54 
 
 
1264 aa  341  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  28.66 
 
 
1228 aa  332  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  27.54 
 
 
1218 aa  327  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  27.46 
 
 
1218 aa  326  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
601 aa  320  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  36.31 
 
 
596 aa  319  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  27.62 
 
 
1218 aa  316  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
598 aa  315  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  36.17 
 
 
603 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  27.68 
 
 
1218 aa  314  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  36.5 
 
 
586 aa  310  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.72 
 
 
580 aa  308  3e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21548  predicted protein  32.98 
 
 
1360 aa  309  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.50837  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  27.46 
 
 
1218 aa  308  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  36.85 
 
 
623 aa  308  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.58 
 
 
601 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.65 
 
 
601 aa  306  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.38 
 
 
598 aa  306  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  36.1 
 
 
586 aa  305  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.1 
 
 
627 aa  305  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.58 
 
 
556 aa  303  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01193  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.42 
 
 
589 aa  303  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.169603  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20026  predicted protein  33.51 
 
 
646 aa  301  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.33 
 
 
598 aa  301  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.04 
 
 
634 aa  300  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.98 
 
 
608 aa  299  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.86 
 
 
597 aa  297  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 
619 aa  297  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  35.11 
 
 
586 aa  296  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.61 
 
 
589 aa  294  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.66 
 
 
641 aa  294  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.11 
 
 
586 aa  294  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.18 
 
 
603 aa  293  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.59 
 
 
632 aa  293  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.27 
 
 
594 aa  293  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1828  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36 
 
 
600 aa  292  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.924491 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06436  ABC multidrug transporter (Eurofung)  45.61 
 
 
343 aa  291  5.0000000000000004e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.402908  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.45 
 
 
639 aa  291  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  33.15 
 
 
614 aa  291  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.78 
 
 
606 aa  290  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.11 
 
 
597 aa  290  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.55 
 
 
628 aa  289  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01030  multidrug resistance protein 1, putative  30.37 
 
 
1706 aa  288  4e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540229  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.26 
 
 
590 aa  288  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.88 
 
 
619 aa  286  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.04 
 
 
600 aa  285  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.69 
 
 
622 aa  284  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.36 
 
 
782 aa  283  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.61 
 
 
614 aa  283  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.36 
 
 
600 aa  283  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.46 
 
 
598 aa  283  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.08 
 
 
597 aa  282  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.76 
 
 
629 aa  282  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.07 
 
 
618 aa  282  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.21 
 
 
600 aa  282  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.08 
 
 
597 aa  282  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0918  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.13 
 
 
616 aa  281  5e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.624051  normal  0.180079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  35.98 
 
 
611 aa  281  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  35.48 
 
 
606 aa  281  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.85 
 
 
589 aa  279  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.87 
 
 
618 aa  279  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4330  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.65 
 
 
605 aa  278  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.630595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.48 
 
 
600 aa  278  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.6 
 
 
613 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.12 
 
 
631 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  35.86 
 
 
594 aa  276  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2914  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.61 
 
 
608 aa  276  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.502763  normal  0.227266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.67 
 
 
586 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  34.29 
 
 
594 aa  275  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.1 
 
 
616 aa  274  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.36 
 
 
605 aa  274  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.2 
 
 
583 aa  273  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.89 
 
 
597 aa  272  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.88 
 
 
597 aa  272  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2021  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.67 
 
 
589 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.47227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.63 
 
 
588 aa  271  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  34.4 
 
 
610 aa  271  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  33.33 
 
 
587 aa  271  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3189  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.62 
 
 
601 aa  270  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1262  ABC transporter-related protein  33.28 
 
 
601 aa  271  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140001 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.18 
 
 
600 aa  269  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  37.68 
 
 
589 aa  269  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.22 
 
 
586 aa  269  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 
571 aa  268  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2119  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.87 
 
 
587 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0646  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.44 
 
 
592 aa  268  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35294  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.33 
 
 
582 aa  268  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>