More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0516 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  59.43 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0577  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.63 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0906  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.67 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00296617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.43 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  50.49 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  51.46 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0948  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0793673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  50.24 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 		 251 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 240 aa  214  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  48.36 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 230 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  49.28 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1666  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  52.2 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  49.76 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  47.83 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  49.76 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  48.11 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  48.37 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  47.83 
 
 		 243 aa  211  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  49.07 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  48.31 
 
 		 241 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  49.52 
 
 		 243 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  48.31 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  208  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  46.86 
 
 		 265 aa  208  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  48.31 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  47.85 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  47.6 
 
 		 244 aa  207  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  49.28 
 
 		 243 aa  207  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  47.83 
 
 		 242 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  48.79 
 
 		 242 aa  207  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  48.08 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  47.57 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  48.31 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  48.15 
 
 		 500 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  44.93 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  47.34 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  45.16 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  50.97 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  47.34 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  49.01 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0468  ABC transporter related  53.4 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  47.83 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  47.14 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0629  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  48.56 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  46.6 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0745  ABC transporter related  49.07 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  46.12 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0713  ABC transporter related  49.07 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0443  ABC transporter related  48.82 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 240 aa  204  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  49.76 
 
 		 242 aa  204  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  47.83 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  46.7 
 
 		 266 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  47.91 
 
 		 264 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  46.86 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  46.86 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  49.76 
 
 		 242 aa  204  8e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  46.63 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  48.06 
 
 		 253 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 242 aa  203  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  45.89 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 242 aa  203  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  45.41 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4555  ABC transporter related  47.44 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  47.34 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  48.8 
 
 		 243 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1061  polar amino acid ABC transporter ATPase  46.98 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0412  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  45.62 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.123929  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  45.63 
 
 		 248 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  48.31 
 
 		 257 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  48.8 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  48.31 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.6 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  47 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>