More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1326 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1326  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 224 aa  446  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00202855  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1533  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  97.76 
 
 		 230 aa  434  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0016393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  47.09 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1012  ABC transporter-related protein  44.69 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  45.05 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  43.89 
 
 		 243 aa  214  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0516  ABC transporter related  47.06 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  43.69 
 
 		 242 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  45.05 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  44.59 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05528  arginine transporter ATP-binding subunit  45.13 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  42.79 
 
 		 253 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  41.96 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  44.8 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  43.69 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  44.8 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13310  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.98 
 
 		 255 aa  208  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  45.05 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  45.05 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0611  ATPase  44.04 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.355376  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  43.69 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  41.7 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 246 aa  207  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1924  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.8 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  207  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  42.15 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  44.1 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  44.8 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  44.8 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  44.34 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  44.19 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  45.25 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  45.09 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  45.05 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0887  ABC transporter related  47.58 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000314613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  45.13 
 
 		 267 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2139  ABC transporter related  43.24 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333723 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  44.8 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  44.59 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  43.12 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2622  ABC transporter related  44.8 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6012  ABC transporter related  42.25 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  42.73 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0377  ABC transporter-like  44.3 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  45.71 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  46.85 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  47.3 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.93 
 
 		 592 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.81 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.59 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  41.63 
 
 		 243 aa  205  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 		 242 aa  205  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.59 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  44.34 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  44.2 
 
 		 254 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.59 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  44.14 
 
 		 360 aa  205  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.59 
 
 		 250 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  46.98 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  44.59 
 
 		 250 aa  204  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  45.05 
 
 		 240 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  43.89 
 
 		 241 aa  204  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  44.64 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>