More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2036 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2036  ABC transporter related  100 
 
 		 544 aa  1063    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.96 
 
 		 557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.53 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.09 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  28.81 
 
 		 581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  28.81 
 
 		 581 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  28.75 
 
 		 581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  25.11 
 
 		 551 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  25.74 
 
 		 558 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  28.19 
 
 		 607 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  28.19 
 
 		 607 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  28.19 
 
 		 607 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.81 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  28.25 
 
 		 581 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  26.41 
 
 		 558 aa  114  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  25.84 
 
 		 548 aa  114  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  27.44 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  26.26 
 
 		 550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  25.26 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  24.53 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  28.02 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  24.86 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.85 
 
 		 564 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  26.67 
 
 		 554 aa  110  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  25.8 
 
 		 556 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  22.45 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.45 
 
 		 562 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  24.18 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.42 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.42 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  27.97 
 
 		 562 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.22 
 
 		 562 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  30.93 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  26.08 
 
 		 556 aa  107  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  25.67 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  23.67 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  26.71 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  24.21 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  27.41 
 
 		 597 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.11 
 
 		 547 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  24.16 
 
 		 547 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  24.55 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  24 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  24.55 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.4 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  27.97 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  27.25 
 
 		 588 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  23.95 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  27.46 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.45 
 
 		 564 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  27.25 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  26.86 
 
 		 558 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  23.62 
 
 		 551 aa  96.7  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  22.93 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.64 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.41 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.41 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  24.09 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.41 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  23.41 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  23.41 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  23.41 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  23.41 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  24.54 
 
 		 567 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  22.47 
 
 		 650 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  32.23 
 
 		 563 aa  93.6  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  19.89 
 
 		 1055 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  21.96 
 
 		 548 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  25.61 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  24.11 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  27.98 
 
 		 551 aa  87.8  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  22.09 
 
 		 544 aa  87.4  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  26.26 
 
 		 571 aa  87  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  20.04 
 
 		 1032 aa  87  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  27.08 
 
 		 544 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  29.78 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  22.69 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  22.71 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  22.68 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  22.45 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  22 
 
 		 543 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1843  ABC transporter related  35.03 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.468577 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.84 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  30.54 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  28.35 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  30.64 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  34.67 
 
 		 240 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  34.17 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  31.74 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  30 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  26.04 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1591  ABC transporter related  32.02 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.243746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>