More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0342 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0342  ABC transporter related protein  100 
 
 
332 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3496  ABC transporter-like protein  64.95 
 
 
384 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3089  ABC transporter related  48.35 
 
 
340 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3543  ABC transporter related  61.78 
 
 
271 aa  271  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0163  ABC transporter-like  43.98 
 
 
333 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2251  ABC transporter related  52.28 
 
 
342 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0279  ABC transporter related  39.47 
 
 
339 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0343631  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2112  ABC transporter related  44.41 
 
 
330 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00532716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3338  ABC transporter related  43.54 
 
 
347 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1297  ABC transporter related  44.04 
 
 
357 aa  229  7e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.934919  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1005  ABC transporter related  40.46 
 
 
365 aa  227  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0737536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5233  ABC transporter related  48.08 
 
 
268 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0646  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 
333 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.473104 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.59 
 
 
392 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.495762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0112  ABC transporter related  36.99 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.818375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0080  ABC transporter related  38.13 
 
 
258 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.871899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0281  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
393 aa  188  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  40.89 
 
 
412 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0128  ABC transporter related  35.17 
 
 
376 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.84 
 
 
263 aa  182  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0672  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
252 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.164199 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.01 
 
 
265 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.47 
 
 
268 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1934  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
296 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2080  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
296 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0934583  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1155  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255553  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1635  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0148634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1920  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components  43.33 
 
 
296 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0867  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00729105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0294  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1610  ABC transporter related  41.3 
 
 
282 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  37.86 
 
 
270 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1603  ABC transporter related  40.89 
 
 
280 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.247677  decreased coverage  0.000149887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  35.17 
 
 
272 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 
282 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
272 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24440  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.77 
 
 
259 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
296 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
270 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  37.1 
 
 
265 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  44.9 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  36.52 
 
 
455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  37.1 
 
 
265 aa  156  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  31.01 
 
 
259 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
270 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
270 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
272 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  37.04 
 
 
270 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1532  ABC transporter related  40.08 
 
 
283 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  36.9 
 
 
259 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
270 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4044  ABC transporter related  43.91 
 
 
281 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  40.52 
 
 
285 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1553  ABC transporter related  40.08 
 
 
283 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.620794  normal  0.876561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4500  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
272 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  35.34 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4448  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
272 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
259 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  38.93 
 
 
271 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  33.61 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
270 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 
256 aa  152  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  36.1 
 
 
281 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  37.92 
 
 
296 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  45.28 
 
 
266 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.78 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
273 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.43 
 
 
268 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.83 
 
 
274 aa  149  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0691  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  38.29 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.95 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  40.81 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1814  ABC transporter related  37.5 
 
 
275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
273 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  39.58 
 
 
293 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  35.36 
 
 
263 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.78 
 
 
273 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.78 
 
 
273 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  35.54 
 
 
264 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3508  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.71 
 
 
265 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000160242  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0143  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.71 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2424  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.78 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0155  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  37.71 
 
 
265 aa  146  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00149  hypothetical protein  37.71 
 
 
265 aa  146  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>