More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00164 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 344 aa  706    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  44 
 
 		 377 aa  272  8.000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.5 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  43.55 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  42.77 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  41.95 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  41.67 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.36 
 
 		 390 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.72 
 
 		 369 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  44.38 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.05 
 
 		 347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.55 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  41.29 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.24 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  41.09 
 
 		 369 aa  240  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  41.6 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.51 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.85 
 
 		 358 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.23 
 
 		 357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.09 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.56 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  41.12 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.18 
 
 		 366 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.13 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  40.29 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42.14 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 1057 aa  233  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.41 
 
 		 353 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  40.49 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  41.19 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  40.69 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  41.19 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.41 
 
 		 349 aa  228  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  40.9 
 
 		 410 aa  229  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  39.22 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  45.87 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.49 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.52 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.37 
 
 		 375 aa  225  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  35.28 
 
 		 367 aa  225  8e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  40.95 
 
 		 341 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.12 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.12 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  42.52 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  42.52 
 
 		 360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  39.94 
 
 		 355 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  40 
 
 		 361 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  47.23 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  38.49 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  40.77 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  40.13 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  39.82 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40.38 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  38.57 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.25 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  39.82 
 
 		 349 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  38.64 
 
 		 399 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  38.63 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  35.67 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  35.55 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  38.4 
 
 		 405 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  41.1 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.39 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  41.1 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  37.32 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  42.86 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  41.24 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  42.11 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.27 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  47.03 
 
 		 365 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.07 
 
 		 355 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.23 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  39.06 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  37.01 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  41.42 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  35.54 
 
 		 347 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1456  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.51 
 
 		 358 aa  215  7e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  43.94 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  38.16 
 
 		 389 aa  215  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.5 
 
 		 377 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  40.37 
 
 		 363 aa  215  9e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  39.23 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  48.94 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  37.09 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  40.91 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  38.54 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  40.91 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>