More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1173 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  651    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  56.89 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  54.35 
 
 		 342 aa  348  8e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  57.01 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  57.86 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.66 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  53.41 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  46.72 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  47.63 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  47.63 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.57 
 
 		 378 aa  289  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  46.06 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  45.98 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  46.4 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  50 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  46.22 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  46.22 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  50 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  46.94 
 
 		 353 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  44.82 
 
 		 398 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 		 369 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  44.9 
 
 		 396 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  45.56 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  46.11 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  45.45 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  46.29 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.64 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  49.55 
 
 		 368 aa  278  7e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  45.62 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  51.47 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.23 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  45.95 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  46.67 
 
 		 389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  47.18 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.23 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  51.49 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  47.18 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.51 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  47.18 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  44.13 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  47.32 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.69 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  46.84 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  46.51 
 
 		 349 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  46.51 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  47.04 
 
 		 349 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  44.22 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  44.19 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  43.77 
 
 		 384 aa  268  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  54.33 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 371 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  51.67 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  46.55 
 
 		 357 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.92 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  46.13 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.86 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  43.6 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  46.31 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  42.57 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  48.39 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  41.21 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  47.95 
 
 		 353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  45.48 
 
 		 342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  47.74 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 367 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 354 aa  265  7e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  45.51 
 
 		 342 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 		 349 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  49.7 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  47.59 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  47.59 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  50.93 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  47.59 
 
 		 346 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  46.31 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 352 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.37 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.45 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  44.73 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.1 
 
 		 367 aa  262  8e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  46.15 
 
 		 386 aa  261  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  46.87 
 
 		 364 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  52.31 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  48.42 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.97 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  46.67 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  44.94 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 348 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  46.55 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  42.77 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  48.42 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  48.42 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>