More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1085 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 389 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  72.65 
 
 		 356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  68.31 
 
 		 386 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  70.28 
 
 		 354 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  69.32 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  69.04 
 
 		 365 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  69.04 
 
 		 358 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  69.32 
 
 		 358 aa  498  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  66.2 
 
 		 361 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  63.97 
 
 		 376 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  57.73 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  55.26 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  57.35 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  57.56 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  53.19 
 
 		 347 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  51.85 
 
 		 353 aa  352  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  52.35 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  51.53 
 
 		 369 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  49.73 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 		 353 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  54.14 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 		 369 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  52.92 
 
 		 369 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  51.25 
 
 		 369 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  51.53 
 
 		 369 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  54.14 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  48.89 
 
 		 355 aa  328  9e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  52.37 
 
 		 369 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  47.49 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  49.85 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  51.27 
 
 		 415 aa  315  9e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  50.42 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  47.25 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  50.73 
 
 		 355 aa  301  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  52.07 
 
 		 360 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  51.96 
 
 		 360 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  61.51 
 
 		 257 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  60.32 
 
 		 257 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  59.92 
 
 		 257 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  60.32 
 
 		 257 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  59.13 
 
 		 257 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.45 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.35 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.07 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.6 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  59.29 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  59.29 
 
 		 256 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.73 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.89 
 
 		 256 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.89 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.68 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  58.89 
 
 		 256 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  40.46 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  41.76 
 
 		 343 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 349 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  48.54 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  48.54 
 
 		 360 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.05 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.51 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  43.17 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  63.18 
 
 		 228 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  46.05 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  53.16 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.47 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  39.04 
 
 		 360 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.12 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.18 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.47 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.11 
 
 		 349 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  39.94 
 
 		 349 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.07 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  50.6 
 
 		 342 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  43.12 
 
 		 343 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.6 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.81 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 		 342 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  40.95 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  38.16 
 
 		 344 aa  235  9e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.81 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  39.77 
 
 		 347 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  39.58 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  39.43 
 
 		 343 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  41.3 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.82 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  41.69 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.72 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1871  ABC transporter related  46.72 
 
 		 359 aa  228  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.541718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>