More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0122 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  100 
 
 		 347 aa  719    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3233  ABC transporter related  57.1 
 
 		 344 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.611679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2734  ABC transporter related  50 
 
 		 339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.367354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2479  ABC transporter related  48.26 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1946  ABC transporter related  47.5 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  46.29 
 
 		 346 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1465  ABC transporter related  48.55 
 
 		 371 aa  308  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.778579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  47.16 
 
 		 359 aa  298  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1077  ABC transporter related  48.59 
 
 		 382 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  45.54 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  42.45 
 
 		 353 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  51.05 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 376 aa  266  4e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.5 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  42.07 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  50.63 
 
 		 355 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0297  ABC transporter related  44.38 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.292775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.25 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  39.51 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1606  ABC transporter related  44.1 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4448  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.11 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3609  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.11 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00717179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3918  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.11 
 
 		 370 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  42.73 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  53.14 
 
 		 355 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  44.38 
 
 		 368 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  51.03 
 
 		 358 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  43.79 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  42.27 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  46.15 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.39 
 
 		 365 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  46.76 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.94 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4665  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.11 
 
 		 380 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.879572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.69 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.94 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4601  ABC transporter related  42.3 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.531787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  39.32 
 
 		 368 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.06 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.16 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.83 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.16 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  52.5 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  51.67 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6322  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.02 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0819115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.16 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5428  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.47 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.48813  normal  0.102518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  42.01 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0642  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.24 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.680948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  48.95 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5570  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1518  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0467578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1348  ABC transporter related  45.24 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.16 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  51.46 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  49.2 
 
 		 352 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.27 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.8 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  45.17 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.05 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  38.89 
 
 		 352 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  51.46 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.78 
 
 		 372 aa  255  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.95 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  48.04 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  44.55 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  45.74 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  51.46 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.29 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  39.33 
 
 		 358 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  43.05 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  51.67 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.03 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 393 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.72 
 
 		 369 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  44.12 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.03 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.03 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.03 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  51.05 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  38.03 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.03 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  48.8 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  51.91 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  52.72 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>