More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1406 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  100 
 
 		 368 aa  733    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  55.18 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  53.22 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  54.04 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  55.18 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  53.65 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  48.25 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  49.72 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 387 aa  282  8.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  45.24 
 
 		 352 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  43.85 
 
 		 352 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  41.82 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  47.54 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  48.68 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  49.55 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  45.2 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 352 aa  277  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  44.82 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  46.51 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  50.75 
 
 		 360 aa  273  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.82 
 
 		 375 aa  272  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.71 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.06 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  47.75 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  48.84 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  45.34 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  38.81 
 
 		 352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  47.45 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  47.81 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  47.38 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  46.22 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  47.16 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  47.45 
 
 		 358 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.95 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  38.51 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  46.11 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  51.4 
 
 		 352 aa  262  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  45 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 		 341 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  45.92 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  44.41 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  42.3 
 
 		 355 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  44.85 
 
 		 368 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  45.03 
 
 		 366 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.6 
 
 		 386 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.08 
 
 		 363 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  43.82 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  43.81 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.78 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  43.85 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.48 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  43.49 
 
 		 337 aa  252  9.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  42.36 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  41.69 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  41.48 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.58 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  43.4 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.4 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  43.02 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  44.22 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  42.55 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.4 
 
 		 349 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  41.4 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  44.38 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  43.08 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  45.85 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  45.85 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  44.32 
 
 		 371 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  45.85 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  48.44 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  42.08 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  46.84 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 333 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.66 
 
 		 358 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  61.47 
 
 		 257 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 366 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  48.44 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  50 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.08 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  44.82 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  40.32 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.94 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.98 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>