More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0781 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 349 aa  707    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50.71 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 		 343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  50.85 
 
 		 349 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  49.86 
 
 		 342 aa  328  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  50.56 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  50.56 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  49 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  50.28 
 
 		 349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  50.15 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  49.15 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  49.4 
 
 		 343 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  48.87 
 
 		 349 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  48.87 
 
 		 349 aa  318  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  48.87 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 349 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  45.66 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  46.76 
 
 		 342 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  45.85 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  43.48 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  43.84 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.57 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  39.69 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  38.46 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 369 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  40.11 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.84 
 
 		 362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  36.29 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  38.46 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  39.83 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  42.17 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  39.71 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  38.62 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  38.11 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  37.5 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  40.98 
 
 		 369 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  39.62 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  39.71 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  41.88 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  39.56 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  40.32 
 
 		 356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.65 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  39.37 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  38.08 
 
 		 369 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  37.71 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  37.04 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.88 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  39.94 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  48.12 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  35.89 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.61 
 
 		 352 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 378 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  42.04 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  38.76 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  36.78 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  44.92 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  39.13 
 
 		 362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.53 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  39.06 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  48.39 
 
 		 257 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  35.59 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  49.17 
 
 		 257 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.37 
 
 		 382 aa  238  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  46.25 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  39.88 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  35.41 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  47.77 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  37.88 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  48.33 
 
 		 257 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  47.77 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  38.19 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  38.86 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 343 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  36.12 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  52.31 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.34 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.23 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.23 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.23 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  42.16 
 
 		 329 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  39.94 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>