More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6542 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  100 
 
 
362 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  78.86 
 
 
359 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  79.14 
 
 
359 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  78.16 
 
 
356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  73.2 
 
 
356 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  63.25 
 
 
355 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  58.99 
 
 
356 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  56.29 
 
 
348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  51.24 
 
 
363 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  51.24 
 
 
363 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.25 
 
 
363 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  52.25 
 
 
360 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  51.69 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  51.4 
 
 
360 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  51.4 
 
 
360 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  51.69 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  52.01 
 
 
366 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  50.42 
 
 
339 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
342 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  50.57 
 
 
342 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.37 
 
 
351 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  50.57 
 
 
368 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  50 
 
 
356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  48.84 
 
 
364 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  51.15 
 
 
365 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.42 
 
 
347 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  50 
 
 
350 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.33 
 
 
347 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  48.73 
 
 
347 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.89 
 
 
358 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.4 
 
 
365 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.4 
 
 
370 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
343 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 
353 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.6 
 
 
372 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.21 
 
 
353 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 
372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  50.17 
 
 
353 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  45.01 
 
 
384 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.93 
 
 
353 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.66 
 
 
353 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 
353 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.69 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  46.04 
 
 
363 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.78 
 
 
352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.11 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  41.48 
 
 
352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  41 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  43.85 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 
363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  41.13 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.96 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  45.6 
 
 
353 aa  281  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 
365 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  42.98 
 
 
362 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
352 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.17 
 
 
372 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.23 
 
 
356 aa  281  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
380 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  42.12 
 
 
350 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  40.62 
 
 
352 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  43.35 
 
 
349 aa  279  6e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.59 
 
 
353 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 
365 aa  278  9e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.27 
 
 
364 aa  278  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.77 
 
 
374 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.25 
 
 
360 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.06 
 
 
376 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  46.85 
 
 
527 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.55 
 
 
381 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.55 
 
 
380 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 
355 aa  276  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.46 
 
 
363 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 
355 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44 
 
 
387 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
380 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.57 
 
 
376 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.65 
 
 
386 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 
383 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.08 
 
 
372 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 
372 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.08 
 
 
353 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 
374 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2815  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.33 
 
 
381 aa  275  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.72 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.21 
 
 
370 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.61 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.12 
 
 
423 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  43.8 
 
 
387 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.33 
 
 
380 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  48.04 
 
 
364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.51 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.17 
 
 
361 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.3 
 
 
357 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.39 
 
 
364 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
363 aa  272  5.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42 
 
 
373 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  39.33 
 
 
384 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.33 
 
 
393 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>