More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0790 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
372 aa  754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  81.5 
 
 
370 aa  619  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.77 
 
 
352 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.32 
 
 
353 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  58.76 
 
 
353 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 
353 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.3 
 
 
359 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  58.43 
 
 
353 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.29 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  58.14 
 
 
353 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  57.67 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  57.7 
 
 
366 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  58 
 
 
356 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.83 
 
 
353 aa  404  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  58.43 
 
 
352 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  58.72 
 
 
352 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  61 
 
 
344 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  58.72 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  51.75 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.21 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51.82 
 
 
384 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  46.86 
 
 
329 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  47.19 
 
 
364 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.66 
 
 
373 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.18 
 
 
373 aa  310  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.65 
 
 
423 aa  309  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.46 
 
 
366 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.02 
 
 
378 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  50.94 
 
 
349 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  46.7 
 
 
361 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
387 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.53 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  51.58 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  49.71 
 
 
376 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  49.53 
 
 
363 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2120  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 
380 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674614  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  50.16 
 
 
363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.85 
 
 
365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.4 
 
 
329 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
355 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.2 
 
 
379 aa  305  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5403  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.48 
 
 
380 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
378 aa  305  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  54.93 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  47.54 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  44.93 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.43 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.09 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  45.64 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.37 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  44.69 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  45.14 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  50 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.99 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  47.12 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.44 
 
 
380 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.65 
 
 
368 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.59 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.36 
 
 
359 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  49.56 
 
 
387 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  44.38 
 
 
329 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  44.19 
 
 
373 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
381 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  45.07 
 
 
386 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.13 
 
 
362 aa  301  1e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5239  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.94 
 
 
380 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  49.24 
 
 
356 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.15 
 
 
363 aa  300  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 
377 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 
377 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 
377 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  46.06 
 
 
353 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 
368 aa  299  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  47.8 
 
 
371 aa  300  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  51.6 
 
 
379 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  45.77 
 
 
348 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  46.85 
 
 
363 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  45.48 
 
 
372 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  46.67 
 
 
336 aa  298  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.28 
 
 
342 aa  298  8e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  49.32 
 
 
356 aa  298  9e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
331 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 
368 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.07 
 
 
372 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.38 
 
 
380 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688295  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.88 
 
 
388 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.23 
 
 
381 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5179  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.82 
 
 
380 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.65 
 
 
378 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5086  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
380 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
372 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  51.6 
 
 
356 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  47.03 
 
 
350 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.6 
 
 
388 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 
382 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.45 
 
 
331 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.95 
 
 
378 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.2 
 
 
372 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>