More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6502 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
351 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  62.26 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  65.98 
 
 
366 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  61.43 
 
 
363 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  60.88 
 
 
363 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  64.14 
 
 
348 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  61.11 
 
 
360 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  62.32 
 
 
368 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  61.11 
 
 
360 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  61.11 
 
 
360 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  60.83 
 
 
360 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  60.83 
 
 
360 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  64.58 
 
 
342 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  62.43 
 
 
356 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  64.69 
 
 
339 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  63.39 
 
 
342 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  60.7 
 
 
365 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  54.19 
 
 
359 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  54.65 
 
 
356 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  54.47 
 
 
359 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  54.65 
 
 
356 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  53.37 
 
 
362 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  54.34 
 
 
355 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.6 
 
 
347 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  50.14 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  52.34 
 
 
364 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  53.37 
 
 
350 aa  342  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.7 
 
 
347 aa  342  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  51.57 
 
 
358 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  54.37 
 
 
372 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  54.98 
 
 
372 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  51.42 
 
 
347 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  56.34 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
353 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.51 
 
 
353 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.8 
 
 
359 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.56 
 
 
377 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.02 
 
 
362 aa  297  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  48.12 
 
 
353 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  48.58 
 
 
359 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.36 
 
 
353 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  50.46 
 
 
353 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.8 
 
 
353 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.59 
 
 
365 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.98 
 
 
363 aa  294  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  48.75 
 
 
384 aa  293  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  53.41 
 
 
527 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.18 
 
 
388 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.83 
 
 
374 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.06 
 
 
353 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  53.19 
 
 
366 aa  293  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.53 
 
 
366 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.26 
 
 
353 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  47.94 
 
 
357 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  50.8 
 
 
342 aa  292  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.23 
 
 
379 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  50.48 
 
 
364 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 
343 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  48.17 
 
 
363 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 
363 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
345 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.26 
 
 
368 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  44 
 
 
373 aa  287  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.34 
 
 
370 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
372 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.09 
 
 
370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
367 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.56 
 
 
384 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 
367 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  46.53 
 
 
341 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.17 
 
 
374 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.17 
 
 
374 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.29 
 
 
353 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.12 
 
 
360 aa  285  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.71 
 
 
367 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.07 
 
 
354 aa  285  9e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  50.88 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.14 
 
 
369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 
358 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.47 
 
 
372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.23 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.67 
 
 
350 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.19 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.04 
 
 
352 aa  282  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.88 
 
 
447 aa  281  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  52.45 
 
 
357 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  51.02 
 
 
364 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.24 
 
 
356 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  50.16 
 
 
344 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6112  ABC transporter related  47.13 
 
 
368 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.614045  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.6 
 
 
359 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 
369 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.32 
 
 
372 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.35 
 
 
358 aa  280  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  50.88 
 
 
361 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  43.34 
 
 
382 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  44.48 
 
 
352 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>