More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0497 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  100 
 
 		 366 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  62.89 
 
 		 353 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  62.32 
 
 		 353 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  62.04 
 
 		 353 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  61.02 
 
 		 353 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  60.85 
 
 		 359 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  60.06 
 
 		 353 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  60.06 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  60.06 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  60.8 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.77 
 
 		 352 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.98 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.7 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  59.83 
 
 		 352 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  58.97 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  58.69 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  58.36 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.69 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  47.81 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.66 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  48.48 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  50.48 
 
 		 349 aa  302  7.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  48.14 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  48.35 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  45.48 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.69 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.16 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  47.24 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.68 
 
 		 380 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.56 
 
 		 329 aa  298  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.97 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  45.63 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.59 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  49.68 
 
 		 363 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  47.59 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.18 
 
 		 371 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.37 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.71 
 
 		 379 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.23 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.94 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.26 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.54 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  49.68 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  50.77 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  50.77 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  44.92 
 
 		 359 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.59 
 
 		 352 aa  292  5e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.06 
 
 		 362 aa  292  5e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  48.72 
 
 		 363 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.17 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  45.66 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  45.17 
 
 		 363 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.36 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.99 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  49.2 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  49.83 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.54 
 
 		 354 aa  290  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.84 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  50 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  46.06 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  50.16 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.33 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.17 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  44.89 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.88 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  56.02 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  45.48 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  45.48 
 
 		 360 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  51.79 
 
 		 368 aa  289  7e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.7 
 
 		 360 aa  288  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.03 
 
 		 374 aa  288  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45.21 
 
 		 360 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  51.46 
 
 		 376 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  47.28 
 
 		 372 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.23 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  55.19 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.43 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  49.67 
 
 		 379 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  43.3 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  48.23 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.89 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  48.77 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.68 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.32 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  48.22 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  45.21 
 
 		 360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  45.21 
 
 		 360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.5 
 
 		 359 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.01 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>