More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4232 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  93.2 
 
 
353 aa  679    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  93.2 
 
 
353 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
353 aa  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  69.12 
 
 
353 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  68.56 
 
 
353 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  66.67 
 
 
353 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.29 
 
 
352 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  62.89 
 
 
366 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  63.53 
 
 
352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  63.53 
 
 
352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  61.19 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  60.06 
 
 
359 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  61.19 
 
 
356 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  63.82 
 
 
352 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.76 
 
 
370 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.32 
 
 
372 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  60.11 
 
 
344 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.83 
 
 
353 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  48.74 
 
 
349 aa  324  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  48.41 
 
 
368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.88 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  51.12 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  50 
 
 
328 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  47.29 
 
 
329 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  49.85 
 
 
360 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  47.59 
 
 
363 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  50 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.69 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.72 
 
 
329 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  47.74 
 
 
363 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  49.39 
 
 
331 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 
342 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  49.68 
 
 
360 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  44.48 
 
 
356 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  44.41 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.11 
 
 
363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  50.15 
 
 
350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.2 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.72 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  45.58 
 
 
352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  47.2 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  47.2 
 
 
360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  49.39 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  44.01 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  49.69 
 
 
387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.13 
 
 
372 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 
372 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  48.93 
 
 
360 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  48.93 
 
 
360 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.57 
 
 
358 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  52.96 
 
 
361 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  48.04 
 
 
356 aa  301  1e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.9 
 
 
381 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.31 
 
 
366 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  48.17 
 
 
329 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  47.87 
 
 
367 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.58 
 
 
342 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.61 
 
 
386 aa  300  3e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  46.94 
 
 
329 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  47.85 
 
 
329 aa  299  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  44.16 
 
 
353 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  47.13 
 
 
359 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.38 
 
 
370 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.22 
 
 
348 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.61 
 
 
379 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.07 
 
 
359 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  47.32 
 
 
352 aa  297  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.57 
 
 
372 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  48.06 
 
 
363 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.6 
 
 
372 aa  296  5e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  45.4 
 
 
330 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  43.59 
 
 
348 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  46.94 
 
 
329 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.23 
 
 
359 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.96 
 
 
366 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  47.24 
 
 
330 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 
348 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  46.33 
 
 
329 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
348 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  42.45 
 
 
356 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  54.12 
 
 
402 aa  292  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.07 
 
 
373 aa  292  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.92 
 
 
363 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  47.7 
 
 
358 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
333 aa  292  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
423 aa  292  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
366 aa  291  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 
333 aa  291  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  43.06 
 
 
357 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
333 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.18 
 
 
380 aa  291  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  51.63 
 
 
379 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  47.57 
 
 
359 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  45.18 
 
 
364 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  47.27 
 
 
333 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  47.27 
 
 
333 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  47.17 
 
 
367 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  45.81 
 
 
364 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.66 
 
 
355 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  45.85 
 
 
365 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>