More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1896 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  100 
 
 
359 aa  731    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  94.99 
 
 
359 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  84.68 
 
 
356 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  83.57 
 
 
356 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  78.86 
 
 
362 aa  587  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  64.71 
 
 
355 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  61.56 
 
 
356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  58.17 
 
 
348 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.37 
 
 
363 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  54.6 
 
 
360 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  54.04 
 
 
363 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  54.6 
 
 
360 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  54.6 
 
 
360 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  53.76 
 
 
363 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  54.04 
 
 
360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  54.04 
 
 
360 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  54.42 
 
 
342 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  54.65 
 
 
364 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  54.02 
 
 
366 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  54.39 
 
 
342 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  52.71 
 
 
368 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.19 
 
 
351 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  53.87 
 
 
339 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  53.45 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  51.72 
 
 
356 aa  362  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  53.74 
 
 
350 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.59 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.63 
 
 
347 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.9 
 
 
358 aa  316  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 
353 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  47.73 
 
 
352 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  47.16 
 
 
352 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.04 
 
 
352 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.31 
 
 
347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.36 
 
 
372 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.39 
 
 
370 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.07 
 
 
353 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.75 
 
 
376 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.76 
 
 
372 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
343 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.95 
 
 
344 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
353 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  46.5 
 
 
372 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  46.69 
 
 
353 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 
372 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  46.59 
 
 
362 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.04 
 
 
377 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.1 
 
 
353 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  44.92 
 
 
366 aa  292  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 
353 aa  291  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.13 
 
 
356 aa  291  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.15 
 
 
362 aa  291  9e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  41.6 
 
 
353 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  46.15 
 
 
356 aa  290  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.84 
 
 
365 aa  288  8e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.22 
 
 
350 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  48.01 
 
 
352 aa  288  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.87 
 
 
352 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.54 
 
 
353 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  41.6 
 
 
353 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
359 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 
370 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 
363 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.65 
 
 
359 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.43 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.3 
 
 
353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.46 
 
 
447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.61 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  42.45 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.63 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.71 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.61 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.84 
 
 
387 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.65 
 
 
381 aa  283  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.45 
 
 
358 aa  282  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.73 
 
 
356 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.17 
 
 
360 aa  281  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  47.27 
 
 
363 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  47.17 
 
 
353 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.96 
 
 
369 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 
369 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  47.92 
 
 
353 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.99 
 
 
423 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.46 
 
 
383 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  44.87 
 
 
342 aa  280  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
381 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 
372 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.66 
 
 
377 aa  280  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
384 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.69 
 
 
352 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 
376 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 
355 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.58 
 
 
380 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  45.85 
 
 
374 aa  278  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.59 
 
 
342 aa  278  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.57 
 
 
382 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
374 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>