More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4680 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  100 
 
 		 358 aa  698    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  55.74 
 
 		 353 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  50.27 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  51.65 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  50.27 
 
 		 363 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  51.1 
 
 		 360 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  51.1 
 
 		 360 aa  328  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.14 
 
 		 363 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  50.41 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  50.41 
 
 		 360 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  48.16 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  49.44 
 
 		 342 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  44.04 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  47.9 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.14 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  47.62 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  47.62 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.97 
 
 		 366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  48.88 
 
 		 342 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 		 351 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  51.1 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  61.32 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  46.89 
 
 		 362 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  51.06 
 
 		 347 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  50.6 
 
 		 356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46.63 
 
 		 356 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  49.14 
 
 		 339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.54 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  51.53 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  50.14 
 
 		 365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.88 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  48.75 
 
 		 362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  47.32 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  58.3 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  53.85 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  50.31 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  44.84 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.4 
 
 		 408 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.99 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 		 372 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.48 
 
 		 379 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  46.17 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  48.03 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.47 
 
 		 376 aa  296  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.13 
 
 		 365 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.73 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.17 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 		 356 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 		 382 aa  295  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  49.03 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  51.6 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  47.9 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  46 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.6 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.7 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  46.18 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.68 
 
 		 372 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  44.1 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.94 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.4 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.43 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.4 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.99 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.2 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  48.81 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.31 
 
 		 365 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.38 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.01 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.57 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  46.09 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  46.46 
 
 		 348 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 370 aa  289  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.81 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 362 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.81 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.89 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.84 
 
 		 376 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.67 
 
 		 399 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.32 
 
 		 346 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.53 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.33 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.75 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  49.04 
 
 		 353 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.67 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.13 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  47.13 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.55 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  45.77 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>