More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7050 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  85.11 
 
 
356 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  83.57 
 
 
359 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  83.01 
 
 
359 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  73.2 
 
 
362 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  67.89 
 
 
355 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  62.64 
 
 
356 aa  461  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  58.17 
 
 
348 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.92 
 
 
363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  56.94 
 
 
360 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  56.67 
 
 
360 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  56.67 
 
 
360 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  55.92 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  55.37 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  56.67 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  56.67 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  56.32 
 
 
366 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  54.02 
 
 
356 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.65 
 
 
351 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  52.69 
 
 
368 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  54.6 
 
 
365 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
342 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  53.49 
 
 
364 aa  362  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  53.43 
 
 
339 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  52.57 
 
 
342 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.59 
 
 
347 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  52.69 
 
 
350 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.69 
 
 
347 aa  332  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  49.68 
 
 
347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.63 
 
 
358 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.3 
 
 
370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  47.34 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.61 
 
 
352 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  54.2 
 
 
372 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.01 
 
 
362 aa  300  3e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  48.94 
 
 
372 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  51.78 
 
 
362 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
353 aa  298  8e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.63 
 
 
366 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.02 
 
 
359 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.64 
 
 
370 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
353 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.83 
 
 
353 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.94 
 
 
353 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.4 
 
 
358 aa  291  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  51.21 
 
 
353 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
353 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.36 
 
 
372 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.59 
 
 
376 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.25 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.36 
 
 
360 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 
365 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  52.45 
 
 
344 aa  289  6e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 
355 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 
343 aa  288  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.23 
 
 
359 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.73 
 
 
378 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49 
 
 
447 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.71 
 
 
365 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.44 
 
 
352 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.35 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.25 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 
353 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.39 
 
 
380 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.28 
 
 
372 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.82 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.19 
 
 
356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.84 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  48.43 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
353 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.42 
 
 
387 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.32 
 
 
377 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.51 
 
 
356 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  45.06 
 
 
386 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.84 
 
 
381 aa  281  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  49.53 
 
 
359 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  45.11 
 
 
353 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.57 
 
 
408 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.8 
 
 
363 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.12 
 
 
377 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  46.81 
 
 
359 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
363 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.51 
 
 
356 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  45.77 
 
 
363 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 
364 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
357 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.71 
 
 
379 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.31 
 
 
374 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.31 
 
 
374 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 
365 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.65 
 
 
381 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.22 
 
 
376 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.685744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  40.23 
 
 
356 aa  278  8e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.77 
 
 
383 aa  278  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  48 
 
 
357 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  46.05 
 
 
364 aa  278  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>