More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4439 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  100 
 
 
348 aa  714    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  60.8 
 
 
366 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  61.85 
 
 
342 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.99 
 
 
363 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  59.55 
 
 
360 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  61.85 
 
 
342 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  58.99 
 
 
360 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  58.99 
 
 
360 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  59.38 
 
 
363 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  58.45 
 
 
359 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  58.17 
 
 
359 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  58.71 
 
 
363 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.14 
 
 
351 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  58.71 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  58.71 
 
 
360 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  58.97 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  61.38 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  59.03 
 
 
368 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  57.02 
 
 
356 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  58.17 
 
 
356 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  56.29 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  55.75 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  58.36 
 
 
365 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  53.01 
 
 
356 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  53.37 
 
 
364 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.57 
 
 
347 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  50.28 
 
 
350 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.57 
 
 
347 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  48.16 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  48.53 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  48.85 
 
 
353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.71 
 
 
352 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.01 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  47.71 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.44 
 
 
353 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.35 
 
 
370 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.51 
 
 
353 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  44.9 
 
 
362 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
352 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  45.89 
 
 
352 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  44.97 
 
 
366 aa  298  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46 
 
 
372 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.22 
 
 
353 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
360 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3450  ABC transporter related  43.06 
 
 
384 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622564  normal  0.365938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.3 
 
 
353 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.32 
 
 
362 aa  296  3e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.12 
 
 
365 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  49.68 
 
 
344 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.09 
 
 
345 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
384 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.48 
 
 
372 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
357 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 
359 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  45.1 
 
 
357 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.96 
 
 
393 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.97 
 
 
359 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.96 
 
 
372 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.01 
 
 
356 aa  292  7e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.81 
 
 
359 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  45.07 
 
 
352 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  42.3 
 
 
384 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.43 
 
 
372 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.37 
 
 
370 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  46.2 
 
 
367 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  48.55 
 
 
350 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.77 
 
 
395 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 
384 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
353 aa  288  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  44.7 
 
 
352 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 
356 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.01 
 
 
377 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 
370 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 
356 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  45.34 
 
 
356 aa  287  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.76 
 
 
447 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2487  ABC transporter related  43.91 
 
 
379 aa  286  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00872773  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  48.59 
 
 
357 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 
368 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
355 aa  286  5e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 
379 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 
349 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.48 
 
 
384 aa  285  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  48.59 
 
 
355 aa  285  9e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  43.14 
 
 
352 aa  285  9e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  48.94 
 
 
355 aa  285  9e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  47.32 
 
 
527 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.73 
 
 
362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  44.22 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  44.51 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.1 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.18 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>