More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1993 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  95.16 
 
 		 352 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  99.43 
 
 		 352 aa  696    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  63.53 
 
 		 353 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  63.25 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  60.97 
 
 		 353 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  66 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  59.83 
 
 		 353 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  59.26 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.86 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.72 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.95 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.79 
 
 		 359 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  57.22 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  58.97 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.22 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.54 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  52.63 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  51.58 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.88 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  47.04 
 
 		 359 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  50.63 
 
 		 363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  49.42 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  46.76 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  47.34 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  54.55 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  51.7 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.69 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  52.17 
 
 		 350 aa  299  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  49.39 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.89 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  47.01 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  44.87 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  50.76 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50.94 
 
 		 353 aa  296  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.6 
 
 		 355 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  49.37 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  49.68 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.36 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  47.9 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  48.16 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  49.68 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.9 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  49.37 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  48.73 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  50 
 
 		 368 aa  289  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.47 
 
 		 373 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  50.78 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  47.15 
 
 		 329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  49.37 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  49.37 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  46.85 
 
 		 374 aa  288  9e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  51.53 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  49.05 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  49.05 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  47.65 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  45.92 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.96 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  49.53 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.46 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.8 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.78 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.48 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  46.9 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 376 aa  285  8e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44 
 
 		 355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.07 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  44.67 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  44.79 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  48.16 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  46.32 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.32 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.91 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  50.47 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 		 367 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.1 
 
 		 386 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  46.46 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.14 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  48.44 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  47.85 
 
 		 329 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  47.94 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.04 
 
 		 377 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  45.78 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.67 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  41.55 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.45 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  48.77 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  53.36 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40.62 
 
 		 362 aa  279  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.44 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  45.76 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  43.9 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>