More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3743 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
370 aa  748    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.94 
 
 
379 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.58 
 
 
384 aa  335  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.04 
 
 
374 aa  312  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.44 
 
 
382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.59 
 
 
382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.14 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  46.91 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.74 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  46.35 
 
 
363 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 
362 aa  301  9e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 
363 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
363 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  46.78 
 
 
381 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.93 
 
 
383 aa  300  4e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.8 
 
 
379 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  49.38 
 
 
360 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  49.38 
 
 
360 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  49.38 
 
 
360 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.93 
 
 
378 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  46.65 
 
 
360 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.4 
 
 
360 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  46.65 
 
 
360 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.32 
 
 
376 aa  295  6e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  50.64 
 
 
356 aa  295  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
395 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.78 
 
 
377 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.26 
 
 
447 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.96 
 
 
358 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46 
 
 
380 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  49.06 
 
 
353 aa  292  5e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  48.4 
 
 
362 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  50.98 
 
 
356 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 
359 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  47.95 
 
 
353 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.25 
 
 
388 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.09 
 
 
349 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.25 
 
 
384 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.27 
 
 
372 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.54 
 
 
364 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.35 
 
 
359 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.78 
 
 
377 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.04 
 
 
384 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.43 
 
 
380 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.38 
 
 
366 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 
378 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.49 
 
 
381 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  45.74 
 
 
342 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  47.63 
 
 
353 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 
387 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.88 
 
 
366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.37 
 
 
393 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 
342 aa  288  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  44.66 
 
 
382 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
356 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.21 
 
 
384 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.21 
 
 
384 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.53 
 
 
362 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.7 
 
 
384 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.18 
 
 
380 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 
361 aa  287  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.94 
 
 
402 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.21 
 
 
384 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.73 
 
 
378 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
353 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.63 
 
 
348 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.9 
 
 
384 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.72 
 
 
371 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 
372 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  43.29 
 
 
383 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.79 
 
 
359 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
378 aa  286  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3008  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.43 
 
 
378 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.532484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  42.28 
 
 
384 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  43.7 
 
 
371 aa  286  5e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.81 
 
 
370 aa  285  5.999999999999999e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0669112  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.01 
 
 
378 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.35 
 
 
347 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 
381 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  42.28 
 
 
384 aa  285  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.66 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.19 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  44.26 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.71 
 
 
381 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.5 
 
 
353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.74 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.08 
 
 
423 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.45 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  45.07 
 
 
357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  48.08 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.69 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.77 
 
 
386 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.49 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>