More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3541 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  96.67 
 
 
360 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  86.67 
 
 
363 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  86.39 
 
 
363 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  97.5 
 
 
360 aa  719    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  97.5 
 
 
360 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  81.89 
 
 
363 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  66.85 
 
 
366 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  62.36 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  61.52 
 
 
368 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  60.22 
 
 
342 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  62.99 
 
 
365 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  58.99 
 
 
342 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  58.99 
 
 
348 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  60.11 
 
 
339 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 
351 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  57.1 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  56.67 
 
 
356 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  55.43 
 
 
359 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  54.6 
 
 
359 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  56.18 
 
 
355 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  51.4 
 
 
362 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  51.94 
 
 
356 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2706  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.39 
 
 
347 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.251131  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  54.65 
 
 
350 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  52.44 
 
 
364 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  51.1 
 
 
358 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.1 
 
 
347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  46.67 
 
 
353 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  47.14 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.29 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  48.3 
 
 
353 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.93 
 
 
353 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.88 
 
 
353 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 
353 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.38 
 
 
370 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.11 
 
 
379 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3459  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.35 
 
 
378 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.97 
 
 
362 aa  296  5e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.59 
 
 
344 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  44.86 
 
 
350 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 
361 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  47.59 
 
 
363 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.36 
 
 
365 aa  293  3e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.92 
 
 
353 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  48.79 
 
 
353 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.99 
 
 
372 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.11 
 
 
370 aa  291  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.63 
 
 
408 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.82 
 
 
367 aa  291  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
367 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.14 
 
 
377 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.4 
 
 
366 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
383 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.96 
 
 
372 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  43.21 
 
 
373 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.84 
 
 
359 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  49.37 
 
 
352 aa  289  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  51.35 
 
 
364 aa  289  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  49.37 
 
 
352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.96 
 
 
352 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  46.33 
 
 
372 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3338  ABC transporter related  46 
 
 
352 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  45.88 
 
 
363 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  49.05 
 
 
352 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  45.6 
 
 
359 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.82 
 
 
346 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.11 
 
 
354 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.19 
 
 
354 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  44.79 
 
 
353 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  47.35 
 
 
353 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.04 
 
 
356 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.07 
 
 
359 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  47.6 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.66 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.21 
 
 
366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  50.18 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.94 
 
 
373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 
374 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  44.82 
 
 
353 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.32 
 
 
384 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  44.82 
 
 
353 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  50.68 
 
 
372 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
360 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  47.98 
 
 
365 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
365 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 
353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.76 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  46.34 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.81 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.6 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.51 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
350 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
355 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>