More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1587 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  100 
 
 
367 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  56.87 
 
 
376 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.02 
 
 
382 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.34 
 
 
362 aa  316  3e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 
384 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  44.72 
 
 
381 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.97 
 
 
363 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.48 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.4 
 
 
354 aa  306  3e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.92 
 
 
377 aa  305  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  42.47 
 
 
363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.19 
 
 
408 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  41.31 
 
 
353 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  48.2 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.49 
 
 
352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.74 
 
 
363 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  41.6 
 
 
358 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 
349 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  44.66 
 
 
352 aa  302  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.7 
 
 
372 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 
372 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
383 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.61 
 
 
353 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.94 
 
 
372 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  45.68 
 
 
386 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.87 
 
 
353 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  44.62 
 
 
368 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  47.87 
 
 
353 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.72 
 
 
377 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  41.9 
 
 
367 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 
343 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.18 
 
 
376 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.26 
 
 
353 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  44.9 
 
 
356 aa  298  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  42.18 
 
 
363 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  44.03 
 
 
347 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.87 
 
 
356 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.37 
 
 
363 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
360 aa  298  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  43.08 
 
 
353 aa  298  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  41.62 
 
 
360 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 
353 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.02 
 
 
363 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.92 
 
 
349 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.87 
 
 
355 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  46.52 
 
 
356 aa  296  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  40 
 
 
364 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  44.67 
 
 
350 aa  296  4e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  44.97 
 
 
353 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  44.48 
 
 
353 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
353 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  45.6 
 
 
353 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  41.34 
 
 
399 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.75 
 
 
368 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
331 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.82 
 
 
374 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  42.64 
 
 
356 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.69 
 
 
370 aa  292  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
364 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
353 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  43.11 
 
 
350 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  42.41 
 
 
366 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.27 
 
 
365 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
360 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  42.2 
 
 
360 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 
357 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.66 
 
 
423 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 
353 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
362 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.78 
 
 
354 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.35 
 
 
370 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 
370 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  42.2 
 
 
360 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
374 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
383 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 
365 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  42.5 
 
 
379 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  41.91 
 
 
360 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  46.2 
 
 
348 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  41.91 
 
 
360 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  43.58 
 
 
356 aa  290  3e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  40.8 
 
 
367 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  41.08 
 
 
367 aa  289  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  41.05 
 
 
361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  40.9 
 
 
361 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.15 
 
 
364 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.82 
 
 
352 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  45.08 
 
 
353 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.67 
 
 
355 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  42.15 
 
 
360 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
384 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07110  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  41.13 
 
 
389 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  43.41 
 
 
368 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4324  ABC transporter related  41.5 
 
 
368 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0269619  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 
355 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.56 
 
 
373 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
380 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>