More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4034 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 
352 aa  705    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  58.05 
 
 
349 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.1 
 
 
351 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.59 
 
 
349 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  57.31 
 
 
349 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  56.41 
 
 
353 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.84 
 
 
366 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  56.13 
 
 
357 aa  371  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  54.83 
 
 
385 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  56.18 
 
 
402 aa  368  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  54.57 
 
 
355 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  53.37 
 
 
351 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.46 
 
 
369 aa  365  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  57.55 
 
 
358 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.3 
 
 
366 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  55.83 
 
 
360 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  54.96 
 
 
356 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  51.39 
 
 
389 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.72 
 
 
366 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.2 
 
 
367 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  50.98 
 
 
381 aa  362  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  51.54 
 
 
366 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  55.28 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  55.24 
 
 
356 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.95 
 
 
369 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  55.49 
 
 
360 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  53.65 
 
 
363 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  53.44 
 
 
381 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.96 
 
 
369 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 
386 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.97 
 
 
368 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  50.97 
 
 
368 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  52.91 
 
 
365 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  54.28 
 
 
352 aa  358  6e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.1 
 
 
369 aa  358  8e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  56.13 
 
 
351 aa  358  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  55.87 
 
 
349 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.55 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.76 
 
 
380 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  53.45 
 
 
352 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  53.98 
 
 
355 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  52.12 
 
 
344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.69 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  55.21 
 
 
361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.29 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  54.83 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  50.96 
 
 
369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  54.27 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  54.97 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  55.37 
 
 
361 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  54.26 
 
 
352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  54.26 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.04 
 
 
365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.6 
 
 
364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  54.47 
 
 
370 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
363 aa  355  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0262  ABC transporter related  57.23 
 
 
368 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.677851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  52.96 
 
 
366 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  49.44 
 
 
386 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.14 
 
 
366 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  54.06 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  54.34 
 
 
355 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.04 
 
 
380 aa  355  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
366 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  54.8 
 
 
333 aa  355  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  49.46 
 
 
384 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  50.14 
 
 
363 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  50 
 
 
379 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.66 
 
 
373 aa  354  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.2 
 
 
365 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  50.7 
 
 
384 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  55.4 
 
 
353 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  53.95 
 
 
374 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.91 
 
 
367 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.91 
 
 
367 aa  353  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  51.53 
 
 
384 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.49 
 
 
358 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  54.37 
 
 
368 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  53.43 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0364  ABC transporter related  51.54 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.6 
 
 
365 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  48.9 
 
 
372 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  53.85 
 
 
364 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  54.42 
 
 
354 aa  352  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.58 
 
 
386 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  51.54 
 
 
373 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  53.09 
 
 
363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  50 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  53.71 
 
 
355 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  53.17 
 
 
357 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.65 
 
 
351 aa  351  8.999999999999999e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
381 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  53.37 
 
 
366 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  50.14 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>