More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0525 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  97 
 
 		 367 aa  739    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  82.02 
 
 		 368 aa  627  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  73.02 
 
 		 367 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  66.49 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  62.16 
 
 		 370 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  58.92 
 
 		 370 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  59.73 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  60.32 
 
 		 372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  61.02 
 
 		 372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  58.38 
 
 		 369 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  61.73 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  60.48 
 
 		 370 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  58.38 
 
 		 369 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  60.81 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  57.18 
 
 		 369 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  58.97 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  58.97 
 
 		 367 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  57.57 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  56.68 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  57.77 
 
 		 370 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  57.72 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  57.72 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  55.68 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.76 
 
 		 369 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  55.56 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  56.45 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  55.71 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  55.38 
 
 		 369 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  57.18 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  57.18 
 
 		 364 aa  411  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  55.26 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  58.74 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  52.32 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  58.74 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  58.74 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.01 
 
 		 366 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  55.8 
 
 		 381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.01 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.04 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.74 
 
 		 366 aa  401  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  54.52 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  55.01 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  55.62 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.96 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 		 366 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  54.38 
 
 		 376 aa  398  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  55.07 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  55.07 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  53.73 
 
 		 404 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  55.16 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  53.27 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  52.14 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  54.32 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.59 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  54.64 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  54.32 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  54.32 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  50.54 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  56.23 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  52.99 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  52.59 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  54.45 
 
 		 585 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.8 
 
 		 366 aa  381  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  52.32 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.74 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  52.73 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.17 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 404 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  52.73 
 
 		 374 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.37 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  54.95 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  55.98 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  52.29 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  51.5 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  54.74 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.16 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  53.42 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.74 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  51.49 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  50.4 
 
 		 370 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  50.14 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.74 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.74 
 
 		 372 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.64 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  53.42 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>