More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2198 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  81.64 
 
 
406 aa  680    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  100 
 
 
405 aa  831    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  75.43 
 
 
404 aa  591  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  71.81 
 
 
410 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  70.34 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  55.64 
 
 
406 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  56.86 
 
 
399 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.39 
 
 
426 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  57.97 
 
 
416 aa  428  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  56.14 
 
 
409 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  53.15 
 
 
374 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  52 
 
 
370 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  54.14 
 
 
370 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  55.16 
 
 
380 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  53.15 
 
 
372 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  54.27 
 
 
388 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  54.34 
 
 
398 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.51 
 
 
369 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.64 
 
 
398 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.63 
 
 
372 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.27 
 
 
368 aa  401  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.75 
 
 
369 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  54.52 
 
 
367 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  55.22 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.93 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.64 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.27 
 
 
367 aa  396  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.63 
 
 
370 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.86 
 
 
384 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.76 
 
 
367 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.59 
 
 
402 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  52.74 
 
 
370 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  53.4 
 
 
382 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.4 
 
 
381 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  55.5 
 
 
393 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  51.75 
 
 
369 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  50.38 
 
 
370 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.64 
 
 
380 aa  391  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  51.49 
 
 
367 aa  386  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.38 
 
 
370 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  52.36 
 
 
388 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.66 
 
 
393 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  51.49 
 
 
367 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
378 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  52.55 
 
 
398 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  51.78 
 
 
367 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.13 
 
 
369 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  53.13 
 
 
360 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  51.89 
 
 
408 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.87 
 
 
367 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.87 
 
 
367 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.6 
 
 
366 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  52.38 
 
 
363 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.37 
 
 
367 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  55.93 
 
 
366 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  55.93 
 
 
366 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  53.42 
 
 
393 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.6 
 
 
366 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  51.27 
 
 
368 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.97 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  59.88 
 
 
364 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  49.37 
 
 
373 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  50.5 
 
 
364 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  52.41 
 
 
365 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.62 
 
 
366 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  50.51 
 
 
360 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.86 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  50.75 
 
 
364 aa  371  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  48.61 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  51.83 
 
 
393 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.61 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  55.47 
 
 
363 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  50.75 
 
 
364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  50.38 
 
 
369 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  51.76 
 
 
360 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  50.64 
 
 
371 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  50.62 
 
 
381 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  49.87 
 
 
369 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  49.88 
 
 
425 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
372 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 
372 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  52.51 
 
 
363 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  51.76 
 
 
358 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.59 
 
 
372 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  51.01 
 
 
389 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  51.13 
 
 
396 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  50.99 
 
 
405 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  50.12 
 
 
387 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  57.01 
 
 
364 aa  368  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>