More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1202 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  100 
 
 		 393 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  68.8 
 
 		 389 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  67.26 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  66.16 
 
 		 393 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  63.13 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  63.13 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  63.16 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  65.31 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  64.34 
 
 		 398 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  62.94 
 
 		 391 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  58.59 
 
 		 387 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  56.89 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  55.5 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  57.11 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  57.83 
 
 		 368 aa  418  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 		 386 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  55.78 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  53.77 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  54.16 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  54.43 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  54.02 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 409 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  54.31 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.37 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.12 
 
 		 368 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.49 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  52.63 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.49 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.21 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.21 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.21 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.4 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.21 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.49 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  54.49 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  52.94 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.21 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.21 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.26 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.39 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  53.5 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.75 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  53.42 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 375 aa  374  1e-102  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  53.48 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50.38 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.49 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.9 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  51.93 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  51.02 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  52.03 
 
 		 381 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  54.31 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  52.38 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  54 
 
 		 367 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  48.21 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  57.14 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  48.21 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.74 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  47.47 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.14 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 		 366 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  60.34 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  50.51 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.87 
 
 		 410 aa  362  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  50.63 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  53.87 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  53.89 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  49.87 
 
 		 370 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  49.29 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50.9 
 
 		 369 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  52.91 
 
 		 366 aa  358  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  51.77 
 
 		 393 aa  358  7e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  52.01 
 
 		 404 aa  358  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.22 
 
 		 370 aa  358  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.86 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.2 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.36 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.72 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.72 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 374 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  55.07 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  51.02 
 
 		 366 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  49.35 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50 
 
 		 402 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  51.02 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  49.75 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.74 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  52.28 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  48.89 
 
 		 371 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>