More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0810 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  100 
 
 		 396 aa  801    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  75.32 
 
 		 393 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  68.29 
 
 		 389 aa  529  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  67.26 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  66.92 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  61.42 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  61.17 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  61.17 
 
 		 405 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  62.31 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  61.54 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  61.48 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  58.88 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  59.39 
 
 		 388 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  57.93 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  56.71 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  57.14 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  56.01 
 
 		 409 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  56.93 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 368 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  56.89 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  56.56 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.63 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  54.23 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 409 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.34 
 
 		 368 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.82 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.88 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  53.12 
 
 		 410 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.76 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.37 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 370 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  50.77 
 
 		 372 aa  378  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.9 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.11 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.41 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.37 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.13 
 
 		 405 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.26 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.66 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51.23 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  59.23 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  48.61 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  50 
 
 		 372 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 408 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  49.24 
 
 		 378 aa  361  1e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.58 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.32 
 
 		 366 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  54.62 
 
 		 402 aa  359  4e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.75 
 
 		 367 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  49.75 
 
 		 368 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  54.7 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.01 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.7 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  46.67 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  53.41 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  49.36 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 375 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  46.67 
 
 		 365 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.75 
 
 		 367 aa  355  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  46.84 
 
 		 366 aa  356  5e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.84 
 
 		 349 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49 
 
 		 369 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.1 
 
 		 372 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  47.62 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  53.12 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.49 
 
 		 377 aa  354  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.13 
 
 		 382 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  48.99 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  49.62 
 
 		 388 aa  355  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  49.49 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  48.86 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  48.86 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.86 
 
 		 369 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.13 
 
 		 349 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.13 
 
 		 364 aa  352  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  49.37 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  49.37 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  49.37 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.13 
 
 		 349 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  48.48 
 
 		 373 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.5 
 
 		 379 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.55 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  47.59 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>