More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0259 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  100 
 
 
366 aa  748    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  100 
 
 
366 aa  748    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  72.53 
 
 
364 aa  542  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  72.53 
 
 
364 aa  541  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  72.85 
 
 
364 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  72.1 
 
 
364 aa  538  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1905  ABC transporter related  60.37 
 
 
375 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1967  ABC transporter related  59.84 
 
 
375 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2198  ABC transporter related protein  59.84 
 
 
375 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2036  ABC transporter related  59.57 
 
 
375 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  58.18 
 
 
371 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  58.18 
 
 
371 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  58.18 
 
 
372 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  59.67 
 
 
369 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  59.67 
 
 
369 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2647  oligogalacturonide ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
375 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.178507  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1799  ABC transporter related  58.78 
 
 
375 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2574  ABC transporter-related protein  58.38 
 
 
370 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434572  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0776  ABC transporter related  57.82 
 
 
377 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  58.82 
 
 
372 aa  421  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1689  oligogalacturonide ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 
375 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0417023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3291  ABC transporter related  59.2 
 
 
375 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.271876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  56.72 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  56.22 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  59.25 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  57.6 
 
 
372 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  56.52 
 
 
380 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  58.15 
 
 
402 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  56.33 
 
 
367 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  56.99 
 
 
364 aa  408  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  56.27 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  56 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  56.28 
 
 
381 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  56.79 
 
 
366 aa  401  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  57.91 
 
 
370 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  53.87 
 
 
374 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  55.35 
 
 
374 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  53.1 
 
 
366 aa  397  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  55.41 
 
 
367 aa  395  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  55.32 
 
 
368 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  55.41 
 
 
367 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  53.1 
 
 
369 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  54.42 
 
 
366 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.84 
 
 
366 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  52.34 
 
 
365 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  56.52 
 
 
370 aa  388  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  54.69 
 
 
377 aa  385  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.57 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.57 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.3 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.57 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  51.89 
 
 
371 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  55.83 
 
 
370 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  54.69 
 
 
366 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.8 
 
 
406 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  51.34 
 
 
373 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  52.66 
 
 
392 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  55.62 
 
 
366 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  56.87 
 
 
370 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  55.34 
 
 
366 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  50.73 
 
 
426 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  55.88 
 
 
376 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  52.7 
 
 
365 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.83 
 
 
369 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  55.65 
 
 
367 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  55.41 
 
 
367 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
377 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  52.47 
 
 
365 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  53.72 
 
 
362 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.15 
 
 
367 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.37 
 
 
358 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  55.93 
 
 
405 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
366 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  55.14 
 
 
367 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  54.46 
 
 
406 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  56.8 
 
 
360 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  49.5 
 
 
398 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.28 
 
 
365 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  52.72 
 
 
365 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  56.4 
 
 
360 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.28 
 
 
365 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  52.62 
 
 
362 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  52.83 
 
 
369 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.8 
 
 
367 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  52.56 
 
 
369 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  53.07 
 
 
362 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 
359 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  51.8 
 
 
362 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  53.12 
 
 
367 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  52.37 
 
 
362 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  51.94 
 
 
353 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  54.44 
 
 
359 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  51.5 
 
 
367 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  50.54 
 
 
359 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.32 
 
 
395 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  53.8 
 
 
358 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>