More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2647 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2036  ABC transporter related  81.87 
 
 
375 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1967  ABC transporter related  83.73 
 
 
375 aa  656    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2198  ABC transporter related protein  86.93 
 
 
375 aa  678    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1799  ABC transporter related  100 
 
 
375 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2647  oligogalacturonide ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
375 aa  777    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.178507  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1905  ABC transporter related  86.13 
 
 
375 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1689  oligogalacturonide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
375 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0417023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3291  ABC transporter related  79.73 
 
 
375 aa  612  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.271876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0776  ABC transporter related  63.78 
 
 
377 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  58.78 
 
 
366 aa  437  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  58.78 
 
 
366 aa  437  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  56.8 
 
 
364 aa  424  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
364 aa  427  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  56.99 
 
 
364 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
364 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0586  ABC transporter related  53.89 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0525  ABC transporter, ATP-binding protein  53.62 
 
 
371 aa  415  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.143614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1071  ABC transporter ATP-binding protein  53.89 
 
 
372 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.457538  normal  0.825195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2574  ABC transporter-related protein  53.48 
 
 
370 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434572  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  50.39 
 
 
370 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  51.72 
 
 
370 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
371 aa  359  5e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.87 
 
 
367 aa  359  5e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.87 
 
 
367 aa  359  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50.92 
 
 
370 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  51.6 
 
 
402 aa  355  8.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.67 
 
 
369 aa  353  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  48.27 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  51.44 
 
 
376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  50.26 
 
 
367 aa  352  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.53 
 
 
367 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.94 
 
 
367 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.82 
 
 
374 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  49.87 
 
 
365 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
406 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  49.74 
 
 
372 aa  349  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.87 
 
 
369 aa  349  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.33 
 
 
369 aa  346  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.42 
 
 
368 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.6 
 
 
369 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.94 
 
 
380 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.69 
 
 
372 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  50 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  58.31 
 
 
405 aa  342  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  49.74 
 
 
369 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  48.28 
 
 
359 aa  341  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  46.42 
 
 
386 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  48.81 
 
 
371 aa  339  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.01 
 
 
359 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  48.28 
 
 
381 aa  338  8e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.13 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.59 
 
 
374 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  50.14 
 
 
357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  49.87 
 
 
366 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
366 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  49.08 
 
 
373 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.74 
 
 
370 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
409 aa  335  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  50.4 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  50.66 
 
 
367 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  56.27 
 
 
410 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  48.28 
 
 
366 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.14 
 
 
366 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
389 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 
366 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  47.27 
 
 
392 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  48.56 
 
 
384 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  49.47 
 
 
355 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 
366 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 
366 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 
366 aa  332  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 
366 aa  332  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.91 
 
 
366 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.14 
 
 
366 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.47 
 
 
367 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.47 
 
 
367 aa  332  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  47.71 
 
 
363 aa  332  5e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.07 
 
 
367 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  45.55 
 
 
380 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.11 
 
 
364 aa  332  8e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  47.12 
 
 
364 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.87 
 
 
366 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.62 
 
 
366 aa  331  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.69 
 
 
406 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  46.25 
 
 
430 aa  331  1e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.9 
 
 
380 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.76 
 
 
363 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  50.73 
 
 
388 aa  330  2e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  47.21 
 
 
366 aa  330  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  48.41 
 
 
356 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  63.16 
 
 
368 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  45.59 
 
 
425 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.61 
 
 
349 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  47.18 
 
 
353 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  47.34 
 
 
366 aa  329  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  57.09 
 
 
404 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.14 
 
 
357 aa  329  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.53 
 
 
361 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  48.41 
 
 
353 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  48.81 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>