More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2909 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  100 
 
 
372 aa  761    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  78.23 
 
 
370 aa  608  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  73.39 
 
 
370 aa  568  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  68.92 
 
 
370 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  69.62 
 
 
374 aa  544  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  67.65 
 
 
369 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  67.65 
 
 
369 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  66.04 
 
 
384 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  65.95 
 
 
370 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  66.22 
 
 
370 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  64.52 
 
 
367 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  64.52 
 
 
367 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.24 
 
 
366 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.51 
 
 
366 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  63.07 
 
 
366 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.97 
 
 
366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  62.97 
 
 
366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  61.19 
 
 
371 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  59.3 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  61.56 
 
 
367 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  60.48 
 
 
367 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  59.29 
 
 
373 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  60.32 
 
 
367 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  62.13 
 
 
372 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  57.8 
 
 
369 aa  448  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  60.64 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  59.14 
 
 
367 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  59.41 
 
 
368 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  58.87 
 
 
364 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  60.65 
 
 
366 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  58.38 
 
 
380 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  59.57 
 
 
367 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  59.57 
 
 
367 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.63 
 
 
426 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  58.87 
 
 
392 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  57.8 
 
 
363 aa  431  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  57.96 
 
 
378 aa  428  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  57.68 
 
 
381 aa  430  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  57.41 
 
 
365 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.72 
 
 
369 aa  425  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  57.41 
 
 
365 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  57.8 
 
 
367 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  58.02 
 
 
369 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  57.92 
 
 
365 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  57.68 
 
 
367 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  57.64 
 
 
369 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  60.92 
 
 
402 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  55.53 
 
 
366 aa  419  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  56.76 
 
 
364 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  56.76 
 
 
364 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
366 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  57.6 
 
 
366 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  53.15 
 
 
405 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  56.49 
 
 
364 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  55.95 
 
 
364 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  55.64 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  55.91 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  50.51 
 
 
406 aa  404  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.91 
 
 
377 aa  403  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  55.91 
 
 
402 aa  404  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  52.15 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.96 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  56.22 
 
 
360 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
360 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  56.22 
 
 
360 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  56.22 
 
 
360 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 
360 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.75 
 
 
404 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  53.12 
 
 
374 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  52.06 
 
 
380 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.22 
 
 
360 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 
406 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2796  ABC transporter related  56.99 
 
 
338 aa  397  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.854812  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  51.49 
 
 
410 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  54.81 
 
 
365 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51 
 
 
404 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.68 
 
 
360 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  55.68 
 
 
585 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  53.51 
 
 
405 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  53.51 
 
 
405 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  53.51 
 
 
405 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0607  ABC transporter related  51.5 
 
 
397 aa  385  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0567231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  54.5 
 
 
366 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.38 
 
 
393 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  49.62 
 
 
389 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  53.66 
 
 
360 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
368 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.01 
 
 
398 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  52.69 
 
 
368 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  53.53 
 
 
356 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  53.95 
 
 
366 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
409 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  54.99 
 
 
359 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.69 
 
 
375 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>