More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6516 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 406 aa  829    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  81.64 
 
 		 405 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  75.12 
 
 		 404 aa  597  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  73.53 
 
 		 410 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  71.18 
 
 		 404 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  56.58 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  58.48 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  55.67 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  54.24 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  54.5 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  55.75 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  52.51 
 
 		 374 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  55.5 
 
 		 380 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  53.98 
 
 		 370 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  54.22 
 
 		 369 aa  408  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  54.64 
 
 		 388 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.25 
 
 		 372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  56.11 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  51.63 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  54 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  53.52 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.92 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.25 
 
 		 370 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  54.22 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  52.69 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  53.52 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  54.02 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  53.96 
 
 		 367 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  54.27 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.81 
 
 		 368 aa  395  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.01 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.87 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.83 
 
 		 402 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  50.62 
 
 		 369 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  52.72 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 378 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  52.63 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  51.23 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.64 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.13 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  49.75 
 
 		 367 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  50.64 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  52.75 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.68 
 
 		 380 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.69 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.08 
 
 		 381 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.64 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  52.5 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  61.66 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.87 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  50 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  58.1 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  54.76 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  58.1 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.5 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  50.13 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.38 
 
 		 368 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  60.43 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  58.1 
 
 		 364 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  53.13 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  50.25 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  51.02 
 
 		 367 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  51.02 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  52.16 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  51.01 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  52.39 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  52.16 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  51.12 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  58.82 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  50.48 
 
 		 393 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  52.9 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.26 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  51.49 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  52.37 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  56.75 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  51.49 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  50.25 
 
 		 376 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  51.88 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  52.38 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  49.75 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  50.13 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  58.62 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>