More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4683 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  100 
 
 		 398 aa  811    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  58.4 
 
 		 409 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  56.28 
 
 		 406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  56.17 
 
 		 380 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  55.16 
 
 		 380 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  51.39 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  51.74 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  51.64 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.77 
 
 		 381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 404 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  52.53 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.62 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  51.58 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.37 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  53.03 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  53.03 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  53.03 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  52.14 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  50 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  51.51 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.24 
 
 		 370 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  51.39 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.01 
 
 		 372 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 408 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  50.38 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  49.24 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  49.24 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  51.62 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.24 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  48.48 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  48.48 
 
 		 367 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.23 
 
 		 367 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  51.38 
 
 		 367 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.51 
 
 		 398 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.85 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.75 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.75 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  47.99 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  47.22 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.75 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  51 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  49.75 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.5 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  50.38 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.5 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.47 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  50.63 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.12 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  50 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.24 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  46.68 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  46.68 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.15 
 
 		 372 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50 
 
 		 402 aa  363  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.73 
 
 		 360 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 364 aa  363  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  47.47 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  47.47 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  47.47 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  49.75 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  48.61 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.49 
 
 		 436 aa  362  8e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.61 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  51.25 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  48.61 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  47.49 
 
 		 365 aa  359  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  47.97 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  51.48 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  48.99 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  49.36 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  48.36 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  49.63 
 
 		 388 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  46.68 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  49.23 
 
 		 360 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  49.12 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.59 
 
 		 349 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  46.02 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  46.21 
 
 		 371 aa  349  6e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.48 
 
 		 369 aa  348  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>