More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8165 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  100 
 
 		 364 aa  738    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  88.15 
 
 		 364 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  69.89 
 
 		 360 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  69.06 
 
 		 363 aa  501  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  67.58 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  67.4 
 
 		 365 aa  500  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  67.29 
 
 		 375 aa  494  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  68.6 
 
 		 361 aa  494  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  67.49 
 
 		 363 aa  492  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  66.39 
 
 		 366 aa  488  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  66.76 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  66.22 
 
 		 374 aa  488  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  66.39 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  67.2 
 
 		 371 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  64.53 
 
 		 376 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  68.23 
 
 		 359 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  65.14 
 
 		 370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0351  ABC transporter related  65.57 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  63.84 
 
 		 360 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  63.06 
 
 		 379 aa  461  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2792  ABC transporter related protein  64.05 
 
 		 370 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.462226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  64.75 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  64.48 
 
 		 378 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  64.19 
 
 		 356 aa  445  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  61.88 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 375 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  58.67 
 
 		 375 aa  431  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12075  sugar ABC transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 		 357 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3526  ABC transporter related protein  62.53 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4354  ABC transporter related  60.71 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4440  ABC transporter related  60.71 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0354628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4734  ABC transporter related  60.71 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  58.97 
 
 		 360 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  52.27 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.7 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  59.88 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  52.38 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  51.76 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.78 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  59.75 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3093  ABC transporter related  51.09 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.6 
 
 		 370 aa  362  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 356 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  59.25 
 
 		 381 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  57.8 
 
 		 404 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.78 
 
 		 356 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  53.28 
 
 		 360 aa  361  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 368 aa  360  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  52.3 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  51.16 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  55.89 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.45 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  51.52 
 
 		 404 aa  359  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  53.28 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  52.14 
 
 		 370 aa  359  5e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.82 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.76 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.51 
 
 		 356 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  53.58 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.23 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  50.38 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  51.48 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  53.58 
 
 		 367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  52.6 
 
 		 366 aa  355  5e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  51.65 
 
 		 385 aa  355  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  54.21 
 
 		 368 aa  355  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.64 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.96 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.92 
 
 		 380 aa  354  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  49.35 
 
 		 405 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.14 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.98 
 
 		 370 aa  352  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  49.86 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  49.09 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  49.09 
 
 		 405 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  52.01 
 
 		 402 aa  352  5.9999999999999994e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  56.69 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.11 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  49.74 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  51.19 
 
 		 380 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  52.99 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  50.13 
 
 		 378 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 356 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 357 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.09 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  51.23 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.37 
 
 		 357 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  53.62 
 
 		 335 aa  349  4e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.41 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>